20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2471 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  855    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  43.88 
 
 		 417 aa  343  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  44.17 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  39.37 
 
 		 418 aa  271  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  37.06 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2218  PEP-CTERM system associated protein  32.1 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0903748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  27.17 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3067  putative lipoprotein  29.36 
 
 		 440 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00656744  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0834  putative lipoprotein  29.36 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2027  hypothetical protein  28.5 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  27.73 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  24.08 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  25.17 
 
 		 518 aa  57  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  28.57 
 
 		 543 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  26.72 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  25.31 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  25.38 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  32.38 
 
 		 501 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  25.61 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1537  hypothetical protein  23.8 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>