18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1519 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1519  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  978    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0398559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0145  hypothetical protein  33.65 
 
 		 510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2508  PEP-CTERM system associated protein  32.1 
 
 		 513 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.831651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2526  hypothetical protein  26.43 
 
 		 528 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.215866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1982  hypothetical protein  34.17 
 
 		 501 aa  87  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0284  hypothetical protein  24.25 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2389  hypothetical protein  25.42 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2400  hypothetical protein  24.02 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0661  hypothetical protein  20.8 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0515751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2361  hypothetical protein  30.34 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2474  PEP-CTERM system associated protein  27.22 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1773  hypothetical protein  27.33 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2471  hypothetical protein  25.15 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3067  putative lipoprotein  27.15 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00656744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0685  PEP-CTERM system associated protein  25.14 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.697185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3116  hypothetical protein  24.23 
 
 		 543 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.878878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2218  PEP-CTERM system associated protein  24.88 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0903748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>