271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3569 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
454 aa  899    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  45.63 
 
 
457 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  44.54 
 
 
457 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  38.99 
 
 
457 aa  296  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  36.7 
 
 
457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  36.76 
 
 
457 aa  273  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  36.11 
 
 
457 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  39.05 
 
 
455 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  34.35 
 
 
457 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  35.09 
 
 
453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  34.21 
 
 
453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  36.6 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  36.6 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 
429 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 
452 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 
452 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  29.92 
 
 
477 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.5 
 
 
477 aa  166  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 
478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.32 
 
 
458 aa  156  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 
688 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  31.21 
 
 
681 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  31.86 
 
 
683 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
471 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  34.35 
 
 
681 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  30.91 
 
 
680 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  30.28 
 
 
682 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 
682 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  31.42 
 
 
680 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 
652 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  27.53 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  27.57 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  30.96 
 
 
676 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26.42 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 
637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  26.42 
 
 
480 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  29.32 
 
 
920 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 
489 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1351  flagellar hook-associated protein FlgK  26.08 
 
 
440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  27.14 
 
 
487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 
631 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.75 
 
 
549 aa  120  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  24.89 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.84 
 
 
640 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.11 
 
 
465 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 
546 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.43 
 
 
647 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 
432 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 
686 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1736  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 
432 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 
432 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
547 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  25.58 
 
 
539 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
547 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1758  flagellar hook-associated protein FlgK  25.26 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  23.95 
 
 
525 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  30 
 
 
642 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 
685 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  27.19 
 
 
547 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
547 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  27.19 
 
 
547 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1814  flagellar hook-associated protein FlgK  25.26 
 
 
432 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
547 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
547 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
547 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  28.75 
 
 
695 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  26.97 
 
 
631 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
641 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
686 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
638 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  29.3 
 
 
641 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  23.94 
 
 
541 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  29.3 
 
 
641 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  29.11 
 
 
641 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  25.52 
 
 
432 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  25.47 
 
 
432 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 
641 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 
641 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  29.64 
 
 
642 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  25.93 
 
 
541 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  27.82 
 
 
463 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  28.93 
 
 
638 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  28.62 
 
 
641 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  28.17 
 
 
641 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  29.15 
 
 
386 aa  107  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 
657 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 
466 aa  106  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1704  flagellar hook-associated protein FlgK  24.16 
 
 
432 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  26.27 
 
 
637 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
553 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
553 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
553 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
553 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  25.19 
 
 
691 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
553 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  26.02 
 
 
463 aa  104  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  29.14 
 
 
645 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>