39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0044 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0044  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1137    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000379088  hitchhiker  0.00388829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3019  hypothetical protein  31.49 
 
 		 447 aa  107  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000407728  unclonable  0.000000000259922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.51 
 
 		 1283 aa  87.4  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.2 
 
 		 1292 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  36.21 
 
 		 1258 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.61 
 
 		 1286 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  41.67 
 
 		 1265 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.56 
 
 		 1212 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  37.98 
 
 		 1393 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  38.79 
 
 		 1393 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  39.34 
 
 		 1035 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  39.25 
 
 		 1220 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  34.88 
 
 		 656 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  38.61 
 
 		 868 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  40.23 
 
 		 972 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  27.05 
 
 		 868 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 		 1212 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 		 1212 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.66 
 
 		 1212 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  35.38 
 
 		 1107 aa  51.2  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  38.14 
 
 		 587 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  33.33 
 
 		 1311 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  43.04 
 
 		 863 aa  50.4  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.64 
 
 		 868 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  38.14 
 
 		 587 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  41.05 
 
 		 1300 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  35.54 
 
 		 1321 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  38.14 
 
 		 587 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  45.16 
 
 		 1215 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  38.14 
 
 		 587 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 868 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 868 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  38.14 
 
 		 553 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  31.03 
 
 		 868 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  38.38 
 
 		 1300 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  34.18 
 
 		 816 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  32.28 
 
 		 869 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  35.71 
 
 		 867 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  32.5 
 
 		 3278 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>