More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3415 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.07 
 
 		 475 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1744  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.33 
 
 		 485 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  0.184526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.41 
 
 		 462 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.66 
 
 		 483 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.33 
 
 		 478 aa  644    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.49 
 
 		 509 aa  648    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5125  ATP synthase F1, beta subunit  81.16 
 
 		 508 aa  819    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.43 
 
 		 462 aa  661    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0819  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.36 
 
 		 503 aa  808    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.27 
 
 		 476 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  67 
 
 		 480 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.07 
 
 		 475 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3763  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.87 
 
 		 504 aa  810    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3415  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 		 500 aa  1008    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 482 aa  662    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 474 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.43 
 
 		 462 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.33 
 
 		 485 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0912  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.69 
 
 		 504 aa  805    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.21 
 
 		 484 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  66.46 
 
 		 485 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01410  ATP synthase subunit B  79.48 
 
 		 501 aa  806    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.87 
 
 		 484 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.99 
 
 		 462 aa  641    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.2 
 
 		 481 aa  661    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0925  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.56 
 
 		 502 aa  794    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0113019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.94 
 
 		 474 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 		 482 aa  663    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.68 
 
 		 476 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 462 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.34 
 
 		 476 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 476 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  66.8 
 
 		 530 aa  641    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.54 
 
 		 476 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.82 
 
 		 462 aa  657    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.55 
 
 		 484 aa  656    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.35 
 
 		 478 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.87 
 
 		 474 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.11 
 
 		 513 aa  649    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 		 537 aa  650    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  67 
 
 		 519 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0336  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.8 
 
 		 501 aa  829    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.59 
 
 		 481 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7073  ATP synthase F1, beta subunit  82.44 
 
 		 500 aa  842    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.42 
 
 		 484 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 475 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.43 
 
 		 462 aa  663    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  67 
 
 		 484 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.87 
 
 		 474 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  72.23 
 
 		 501 aa  724    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.33 
 
 		 470 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.13 
 
 		 470 aa  634  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  64.92 
 
 		 464 aa  632  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.28 
 
 		 517 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 		 471 aa  634  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  66.19 
 
 		 518 aa  631  1e-179  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.4 
 
 		 465 aa  629  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.64 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.19 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.64 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3652  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 478 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3941  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.26 
 
 		 478 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.49 
 
 		 465 aa  628  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  66 
 
 		 482 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.33 
 
 		 470 aa  628  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  64.86 
 
 		 465 aa  630  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.93 
 
 		 468 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.93 
 
 		 468 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.1 
 
 		 472 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 470 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.3 
 
 		 474 aa  625  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  65 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.29 
 
 		 465 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.53 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.33 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.53 
 
 		 475 aa  622  1e-177  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.8 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.8 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.8 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.71 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.67 
 
 		 473 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.8 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65 
 
 		 469 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.87 
 
 		 473 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.22 
 
 		 479 aa  622  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 464 aa  623  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.33 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.02 
 
 		 493 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.33 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.55 
 
 		 474 aa  618  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.99 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  63.87 
 
 		 547 aa  615  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  65.24 
 
 		 503 aa  615  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  64.72 
 
 		 501 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.99 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.79 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.98 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.43 
 
 		 476 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>