More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0857 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  775    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  45.07 
 
 
374 aa  346  4e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  46.01 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  43.16 
 
 
378 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 
372 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  44.68 
 
 
372 aa  308  9e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  41.07 
 
 
376 aa  286  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
400 aa  189  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
385 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
393 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
417 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
370 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
374 aa  169  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
366 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
397 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
386 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
369 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
371 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
380 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
366 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
395 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
394 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
428 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  34.58 
 
 
430 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  27.59 
 
 
372 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  27.59 
 
 
372 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
431 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
381 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
375 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
371 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  32.01 
 
 
353 aa  149  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.89 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
373 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
387 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
387 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.49 
 
 
364 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
382 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.39 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.39 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
394 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
386 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
382 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
443 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
376 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
381 aa  138  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  35.69 
 
 
366 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  26.95 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
435 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 
414 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 
414 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 
414 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
383 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  30.04 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
395 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
420 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
435 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.98 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 
361 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
360 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.17 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  29.01 
 
 
336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2211  protein RfbU  30.6 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00229627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
377 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
393 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2312  hypothetical protein  29.85 
 
 
353 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.167078  normal  0.0536505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2425  hypothetical protein  29.85 
 
 
353 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274223  hitchhiker  0.000381891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2314  protein RfbU  29.48 
 
 
353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  decreased coverage  0.00611992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
364 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
381 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  30.15 
 
 
364 aa  126  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1813  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
413 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
373 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>