25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0904 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0904  S-type Pyocin  100 
 
 		 731 aa  1475    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5397  S-type Pyocin  42.46 
 
 		 789 aa  340  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0784178  hitchhiker  0.00224956 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4651  S-type Pyocin  47.09 
 
 		 643 aa  336  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0310  HNH endonuclease:S-type Pyocin  38.96 
 
 		 656 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5232  pyocin/colicin protein, putative  39.61 
 
 		 655 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1306  pyocin S-type Killer domain-containing protein  35.05 
 
 		 758 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0164  colicin/pyocin immunity family protein  29.45 
 
 		 601 aa  186  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.827155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  39.35 
 
 		 859 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4761  S-type Pyocin  49.32 
 
 		 416 aa  152  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0685968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  40.26 
 
 		 593 aa  145  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4759  S-type Pyocin  37.85 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.997182  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0883  S-type Pyocin  27.1 
 
 		 678 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.429643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  31.23 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5378  S-type pyocin domain-containing protein  26.69 
 
 		 862 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2036  S-type pyocin domain-containing protein  32.39 
 
 		 578 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3037  killer protein of pyocin S3  30.94 
 
 		 740 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0470  putative cytoplasmic protein  44.33 
 
 		 561 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000218322  decreased coverage  4.8281800000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4048  HNH endonuclease  53.95 
 
 		 83 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49520  pyocin killing protein  28.97 
 
 		 791 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000524369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5377  S-type pyocin domain-containing protein  32.18 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13940  putative S-type pyocin protein  30.13 
 
 		 559 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000194978  normal  0.0797703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4543  S-type pyocin  35.11 
 
 		 106 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.63 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4050  S-type pyocin domain-containing protein  24.89 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.31 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>