211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4533 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  66.4 
 
 		 498 aa  669    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  66.6 
 
 		 498 aa  670    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  66.19 
 
 		 498 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  68.84 
 
 		 498 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  66.4 
 
 		 498 aa  669    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  73.49 
 
 		 498 aa  744    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  66.4 
 
 		 498 aa  669    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  69.59 
 
 		 512 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  100 
 
 		 499 aa  1017    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  66.4 
 
 		 498 aa  669    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  68.84 
 
 		 498 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  76.15 
 
 		 499 aa  767    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  69.18 
 
 		 512 aa  657    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  65.39 
 
 		 498 aa  648    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  68.84 
 
 		 498 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  69.04 
 
 		 498 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  69.59 
 
 		 512 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  95.99 
 
 		 499 aa  980    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  68.64 
 
 		 498 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  66.4 
 
 		 506 aa  668    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  66.4 
 
 		 498 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  69.08 
 
 		 523 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  65.52 
 
 		 468 aa  631  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  40.68 
 
 		 546 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  42.21 
 
 		 552 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  43.48 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  42.34 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  47.08 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  46.83 
 
 		 543 aa  276  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.57 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  43.79 
 
 		 560 aa  249  1e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.76 
 
 		 528 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  46.47 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  46.43 
 
 		 509 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  45.36 
 
 		 509 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  42.21 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.21 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  40.6 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  41.18 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  46.15 
 
 		 466 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  43.61 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.4 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  41.29 
 
 		 498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  38.41 
 
 		 376 aa  170  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.37 
 
 		 477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.02 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.84 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.16 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  33.68 
 
 		 390 aa  140  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.32 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.07 
 
 		 387 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  36.22 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  33.72 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  34.88 
 
 		 368 aa  99.8  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  33.9 
 
 		 368 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  33.33 
 
 		 379 aa  94  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  21.94 
 
 		 315 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  22.22 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.56 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  23.41 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  27.41 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  23.51 
 
 		 302 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  28.19 
 
 		 332 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  24.49 
 
 		 309 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.66 
 
 		 285 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  23.1 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  24.49 
 
 		 309 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  24.81 
 
 		 343 aa  54.3  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  24.15 
 
 		 309 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  25 
 
 		 302 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  24.15 
 
 		 309 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  24.15 
 
 		 309 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  30 
 
 		 324 aa  53.5  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  24.75 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  24.91 
 
 		 312 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.03 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.86 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  25.51 
 
 		 332 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.64 
 
 		 318 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.79 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.61 
 
 		 321 aa  51.2  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.56 
 
 		 305 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  24.41 
 
 		 309 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  23.81 
 
 		 309 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  24.87 
 
 		 332 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  23.24 
 
 		 303 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  22.97 
 
 		 331 aa  50.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1004  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.36 
 
 		 338 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  24.15 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.93 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  31.37 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  23.61 
 
 		 335 aa  50.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  23.81 
 
 		 309 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  28.98 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1383  ATPase  28.8 
 
 		 357 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.17 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  25.09 
 
 		 331 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.43 
 
 		 302 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2146  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.29 
 
 		 327 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2106  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.38 
 
 		 326 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>