More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3936 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  71.01 
 
 		 211 aa  298  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  70.53 
 
 		 211 aa  296  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  66.67 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  63.9 
 
 		 217 aa  275  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  62.62 
 
 		 217 aa  275  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  62.98 
 
 		 218 aa  271  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  57.97 
 
 		 220 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  56.25 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  57.49 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  57.84 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0429  guanylate kinase  56.22 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  54.37 
 
 		 220 aa  234  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  58.29 
 
 		 230 aa  234  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  53.59 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  53.11 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  53.62 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  54.9 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  54.11 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  56.31 
 
 		 212 aa  228  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  53.14 
 
 		 219 aa  225  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  52.17 
 
 		 220 aa  224  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  53.92 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2714  guanylate kinase  51.94 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  50.72 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  53.66 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  54.69 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  54.69 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  54.69 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  54.69 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  54.69 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  54.69 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  54.69 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  54.69 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  54.69 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0576  guanylate kinase  50.49 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  56.67 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  50 
 
 		 220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2781  guanylate kinase  55.87 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  50 
 
 		 220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  51.66 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  51.66 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  51.2 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  54.17 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  54.17 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  54.17 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  54.17 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  54.17 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  54.17 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  52.08 
 
 		 207 aa  204  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  53.12 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  52.6 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  49.23 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  48.47 
 
 		 207 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  50 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  48.47 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  48.47 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  48.47 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  47.96 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  49.04 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1447  guanylate kinase  52.85 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  47.96 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  49.49 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  48.72 
 
 		 207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  52.6 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  50 
 
 		 216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  48.98 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  48.98 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  47.29 
 
 		 206 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  48.47 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  51.04 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  48.54 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  52.63 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  48.17 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  51.04 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  51.04 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  47.96 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  47.32 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  48.17 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  47.45 
 
 		 207 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  45.59 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  47.47 
 
 		 207 aa  194  7e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  47.34 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1290  guanylate kinase  50.74 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  50 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  47.64 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  52.43 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  49.74 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4209  guanylate kinase  52.6 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1003  guanylate kinase  53.66 
 
 		 221 aa  191  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  48.72 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  50 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  49.74 
 
 		 207 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  48.42 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  46.6 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  45 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  52.08 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  46.6 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  49.21 
 
 		 203 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  47.06 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>