271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2918 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 202 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  66.15 
 
 		 212 aa  240  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  59.5 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  62.56 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  64.62 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  59.28 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  61.73 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  56.92 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  56.92 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  58.5 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  57.22 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  64.48 
 
 		 212 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  59.28 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  61.9 
 
 		 213 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  56.84 
 
 		 209 aa  191  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  41.24 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  41.24 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  38 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  36.5 
 
 		 232 aa  164  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  39.47 
 
 		 221 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  37 
 
 		 221 aa  160  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  44.28 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  39.18 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  45.15 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  43.5 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  44.22 
 
 		 474 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  44.5 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  47.18 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  42.16 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  40.2 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  43.46 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  40.7 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  43.41 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  35.03 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  40.74 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  36.36 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  39.79 
 
 		 202 aa  121  8e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  38.17 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  28.87 
 
 		 249 aa  108  4.0000000000000004e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  35.18 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  29.78 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  29.78 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  28.41 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  28.89 
 
 		 190 aa  97.1  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  30.51 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  36.28 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  41.71 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  28.04 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  37.21 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  36.1 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  33.64 
 
 		 224 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 239 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.92 
 
 		 242 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  38.1 
 
 		 239 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  32.3 
 
 		 242 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  31.56 
 
 		 242 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  41.86 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  38.01 
 
 		 244 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  30.09 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  38.95 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  39.05 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  39.41 
 
 		 263 aa  85.5  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 242 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  33.74 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.42 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  30.06 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  39.05 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  37.75 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  34.17 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  40.49 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  30.81 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  32.63 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  38.95 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  32.72 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  36.9 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  32.76 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  36.31 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  30.52 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.55 
 
 		 708 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  37.17 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  36.9 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  38.95 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  32.08 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  33.15 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  29.41 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  33.71 
 
 		 646 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  35.98 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2835  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  38.69 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  29.8 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1163  dethiobiotin synthase  35.8 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  30.51 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  34.51 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>