More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1686 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  100 
 
 		 90 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 92 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 92 aa  120  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  65.17 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  65.17 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 91 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 90 aa  117  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 94 aa  116  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0362  histone-like DNA-binding protein  64.04 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  61.8 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3133  histone-like DNA-binding protein  62.22 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000045924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3008  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.341575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  61.11 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000897645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0133  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000844989  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1275  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2424  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  62.92 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 91 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  60 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0238  histone family protein DNA-binding protein  60.67 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  61.11 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  57.78 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  59.55 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0600  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0791658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2673  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.156087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0658  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  58.89 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_002950  PG0121  DNA-binding protein HU  56.98 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00022412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3261  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3158  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1051  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0016  nucleoid protein HU beta subunit  56.67 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  58.43 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_1493  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1797  HU family DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1607  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1596  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000169185  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3089  transcriptional regulator HU subunit beta  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.42002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2747  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276504  normal  0.581764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3231  transcriptional regulator HU subunit beta  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2492  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000348442  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2560  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000135506  normal  0.0536414 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1630  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000159632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3051  transcriptional regulator HU subunit beta  55.56 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0500  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759527 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  55.56 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0188  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0170  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 94 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000201093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00392  HU, DNA-binding transcriptional regulator, beta subunit  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3169  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000005828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00396  hypothetical protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0517  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000441181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0476  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000220916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0483  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000219434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3192  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0216859  hitchhiker  0.00242013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0526  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00026983  normal  0.698185 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0363  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00017145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0135  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  59.77 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0500  transcriptional regulator HU subunit beta  56.67 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  0.0268714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>