More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1777 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  68.75 
 
 		 192 aa  271  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  61.98 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1589  orotate phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1671  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  34.24 
 
 		 482 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  38.79 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2662  orotate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.8 
 
 		 451 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2296  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.33 
 
 		 479 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2347  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.33 
 
 		 479 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.159703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1051  orotate phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  32.74 
 
 		 500 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0957  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  33.73 
 
 		 477 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0127  orotate phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00677892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0771  orotate phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0263  orotate phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1159  orotate phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.712635  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19418  Uridine 5'- monophosphate synthase  34.07 
 
 		 474 aa  94  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0102475  normal  0.110461 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1264  orotate phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1289  orotate phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0981  orotate phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1046  orotate phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0756339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0953  orotate phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1310  orotate phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 212 aa  91.3  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1463  orotate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.66413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  40.31 
 
 		 215 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1001  orotate phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3709  orotate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0928059  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3931  orotate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 210 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2531  orotate phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 		 210 aa  88.2  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3733  orotate phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 		 210 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3624  orotate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 210 aa  87.8  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4021  orotate phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 		 210 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3927  orotate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3896  orotate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000349219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1261  orotate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 210 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3641  orotate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3980  orotate phosphoribosyltransferase  37.88 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0402  orotate phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1785  orotate phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0239  orotate phosphoribosyltransferase  33.16 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 170 aa  84.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 185 aa  84.7  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 174 aa  84.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  36.72 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  33.75 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0057  orotate phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2888  orotate phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0334106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1094  orotate phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2045  orotate phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  34.57 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1439  orotate phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.653845  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0841  orotate phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.637586 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2604  orotate phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07951  orotate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0107  orotate phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0134  orotate phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 		 229 aa  77.8  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0195  orotate phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0080  orotate phosphoribosyltransferase  29.12 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0216  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0138  orotate phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>