286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1229 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 		 112 aa  227  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  78.57 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  58.18 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  58.18 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  58.18 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  58.18 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  58.18 
 
 		 110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  58.18 
 
 		 110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  57.27 
 
 		 110 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 111 aa  143  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  57.27 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  59.82 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  56.36 
 
 		 110 aa  139  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  55.45 
 
 		 110 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  60.18 
 
 		 110 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  60.18 
 
 		 110 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  63.74 
 
 		 109 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004366  preprotein translocase subunit YajC  63.74 
 
 		 109 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  52.73 
 
 		 110 aa  133  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  63.33 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  57.14 
 
 		 110 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  59.29 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  58.93 
 
 		 111 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  58.41 
 
 		 110 aa  130  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  58.04 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  58.04 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3290  preprotein translocase subunit YajC  58.93 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  58.04 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  61.11 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  58.04 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  61.11 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  57.52 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  61.11 
 
 		 110 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  58.89 
 
 		 91 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  56.67 
 
 		 91 aa  123  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1314  preprotein translocase subunit YajC  60.67 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  55.36 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 109 aa  113  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  56.14 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  47.32 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  56.04 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  52.81 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  54.95 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  54.95 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  52.75 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  52.75 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  51.35 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  47.71 
 
 		 107 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  46.79 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  46.79 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  46.79 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  46.79 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  46.79 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  46.79 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  48.67 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  44.55 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  42.73 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  42.73 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  46.02 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  46.02 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  42.11 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  42.11 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0598  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  43.64 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  51.9 
 
 		 108 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  46.59 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  50.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  50.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  50.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  50.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  50.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  50.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  46.67 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  50.63 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  46.32 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  42.48 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  43.93 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  44.68 
 
 		 116 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>