More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2003 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  74.35 
 
 
308 aa  459  1e-128  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  70.03 
 
 
309 aa  425  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  70.03 
 
 
310 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  67.75 
 
 
311 aa  407  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.92185e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  70.16 
 
 
314 aa  400  1e-110  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  68.4 
 
 
309 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  64.05 
 
 
339 aa  384  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  62.87 
 
 
309 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  65.47 
 
 
311 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  65.15 
 
 
309 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  65.15 
 
 
311 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  4.34249e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  65.15 
 
 
310 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  66.56 
 
 
311 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.5777e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  66.23 
 
 
319 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.69307e-19 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  63.23 
 
 
311 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  61.56 
 
 
309 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  62.01 
 
 
311 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  66.12 
 
 
311 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  60.91 
 
 
309 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  63.73 
 
 
329 aa  367  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  65.68 
 
 
309 aa  364  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  8.25635e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  63.82 
 
 
308 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  62.09 
 
 
322 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  64.59 
 
 
328 aa  364  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3067  cysteine synthase  62.87 
 
 
316 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  62.38 
 
 
308 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  59.02 
 
 
312 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  59.74 
 
 
327 aa  364  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  64.38 
 
 
309 aa  363  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  61.36 
 
 
317 aa  363  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.44 
 
 
308 aa  363  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.70956e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  64.38 
 
 
310 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  62.01 
 
 
309 aa  362  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  60.26 
 
 
309 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  63.61 
 
 
308 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.86941e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  63.28 
 
 
327 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  64.03 
 
 
308 aa  359  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  63.19 
 
 
322 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  57.19 
 
 
311 aa  357  1e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  58.03 
 
 
312 aa  357  1e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  63.84 
 
 
310 aa  357  2e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  62.01 
 
 
328 aa  356  2e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  64.71 
 
 
331 aa  357  2e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  62.01 
 
 
317 aa  356  4e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  63.28 
 
 
309 aa  354  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  65.47 
 
 
309 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  58.5 
 
 
316 aa  353  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  62.62 
 
 
327 aa  352  3e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  60.33 
 
 
309 aa  353  3e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  62.14 
 
 
309 aa  352  4e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  63.07 
 
 
320 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.84 
 
 
310 aa  352  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.13805e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  61.31 
 
 
324 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  63.73 
 
 
320 aa  351  9e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  60.32 
 
 
310 aa  351  9e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  57.38 
 
 
307 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  60 
 
 
320 aa  349  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  60.06 
 
 
318 aa  348  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  59.35 
 
 
330 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  60.39 
 
 
317 aa  346  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  57.51 
 
 
324 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  65.47 
 
 
309 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  59.55 
 
 
322 aa  346  3e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  59.03 
 
 
320 aa  344  9e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  62.62 
 
 
332 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  61.81 
 
 
309 aa  342  6e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  6.03625e-05  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  60.33 
 
 
326 aa  341  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  60.33 
 
 
326 aa  341  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  61.81 
 
 
327 aa  341  8e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  60.71 
 
 
309 aa  341  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  55.92 
 
 
310 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  55.92 
 
 
310 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  64.26 
 
 
332 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  56.95 
 
 
310 aa  340  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  61.24 
 
 
311 aa  340  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  60.65 
 
 
320 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  60.66 
 
 
310 aa  339  3e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  61.81 
 
 
309 aa  340  3e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  62.75 
 
 
310 aa  339  3e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  59.49 
 
 
320 aa  339  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1015  cysteine synthase A  63.73 
 
 
328 aa  338  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  59.67 
 
 
325 aa  338  5e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3080  cysteine synthase  60.39 
 
 
309 aa  338  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  58.69 
 
 
311 aa  337  2e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.76073e-08 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  59.35 
 
 
319 aa  337  2e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  55.19 
 
 
307 aa  336  3e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  5.4726e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  58.5 
 
 
328 aa  336  3e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  63.28 
 
 
332 aa  335  4e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  59.42 
 
 
323 aa  335  4e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  57.19 
 
 
311 aa  335  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2665  cysteine synthase A  58.73 
 
 
323 aa  335  8e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2574  cysteine synthase A  58.73 
 
 
323 aa  335  8e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.79096e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2689  cysteine synthase A  58.73 
 
 
323 aa  335  8e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2623  cysteine synthase A  58.73 
 
 
323 aa  335  8e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  56.72 
 
 
304 aa  334  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  8.30673e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2701  cysteine synthase A  58.73 
 
 
323 aa  334  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.31344e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  55.1 
 
 
324 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  56.68 
 
 
309 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1264  cysteine synthase A  58.41 
 
 
323 aa  332  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.22758e-08  decreased coverage  2.5009e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>