More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5279 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  58.82 
 
 		 796 aa  791    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  67.68 
 
 		 984 aa  913    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  73.87 
 
 		 750 aa  1113    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  62.48 
 
 		 972 aa  872    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  75.31 
 
 		 750 aa  1105    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  68.77 
 
 		 748 aa  937    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 752 aa  1527    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  55.2 
 
 		 939 aa  767    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  66.34 
 
 		 848 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  62.76 
 
 		 712 aa  851    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  59.87 
 
 		 785 aa  793    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0123  heavy metal translocating P-type ATPase  66.62 
 
 		 862 aa  868    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  66.29 
 
 		 800 aa  913    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  65.92 
 
 		 713 aa  878    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  51.91 
 
 		 711 aa  690    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  52.2 
 
 		 713 aa  699    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  93.09 
 
 		 752 aa  1369    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  64.21 
 
 		 743 aa  871    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  54.37 
 
 		 739 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3972  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  65.32 
 
 		 783 aa  890    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  65.77 
 
 		 713 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  76.66 
 
 		 769 aa  1152    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  66.94 
 
 		 866 aa  905    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  75.3 
 
 		 750 aa  1100    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  65.64 
 
 		 834 aa  878    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  61.88 
 
 		 830 aa  881    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  58.3 
 
 		 812 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  59.51 
 
 		 748 aa  857    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  65.25 
 
 		 709 aa  884    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  64.97 
 
 		 828 aa  879    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  65.66 
 
 		 799 aa  894    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  67.68 
 
 		 984 aa  913    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  63.42 
 
 		 794 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  65.08 
 
 		 799 aa  925    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  66.67 
 
 		 846 aa  875    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  65.26 
 
 		 800 aa  939    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  73.6 
 
 		 750 aa  1109    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  63.14 
 
 		 726 aa  912    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  65.26 
 
 		 800 aa  939    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  65.58 
 
 		 801 aa  905    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  68.01 
 
 		 704 aa  872    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  65.73 
 
 		 742 aa  922    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  65.1 
 
 		 832 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  62.71 
 
 		 856 aa  885    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  66.67 
 
 		 846 aa  875    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  63.83 
 
 		 791 aa  887    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0832  heavy metal translocating P-type ATPase  51.19 
 
 		 783 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  54.18 
 
 		 762 aa  720    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  65.17 
 
 		 800 aa  927    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  52.56 
 
 		 745 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  65.15 
 
 		 734 aa  947    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  65.25 
 
 		 799 aa  897    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  50.39 
 
 		 753 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  65.64 
 
 		 834 aa  878    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  65.62 
 
 		 800 aa  897    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  65.64 
 
 		 832 aa  878    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  66.91 
 
 		 701 aa  907    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  66.29 
 
 		 800 aa  913    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_003296  RS05448  metal-transporting P-type ATPase transmembrane protein  46.99 
 
 		 784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481945  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  56.35 
 
 		 629 aa  597  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 1022 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3732  heavy metal translocating P-type ATPase  50.42 
 
 		 783 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4809  heavy metal translocating P-type ATPase  50.42 
 
 		 783 aa  582  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159985  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2915  heavy metal translocating P-type ATPase  51.82 
 
 		 732 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522074  normal  0.0959019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 		 783 aa  555  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  48.9 
 
 		 713 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  47.41 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  41.88 
 
 		 712 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 		 712 aa  538  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  41.68 
 
 		 712 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1214  heavy metal translocating P-type ATPase  53.66 
 
 		 673 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182461  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.85 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2594  heavy metal translocating P-type ATPase  53.66 
 
 		 673 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.037296  normal  0.268336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  41.16 
 
 		 833 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 707 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.53 
 
 		 737 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 767 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 		 734 aa  504  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  39.95 
 
 		 735 aa  495  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  42.07 
 
 		 728 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  42.07 
 
 		 728 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 785 aa  488  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 		 812 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  38.74 
 
 		 868 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 751 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  44.95 
 
 		 718 aa  478  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  38.91 
 
 		 926 aa  472  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 		 904 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 825 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 		 726 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 		 738 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  41.6 
 
 		 750 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  41.99 
 
 		 711 aa  458  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 734 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.9 
 
 		 768 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 		 734 aa  452  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 738 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  38.29 
 
 		 955 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 		 844 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  40.31 
 
 		 712 aa  446  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>