More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2440 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  100 
 
 
395 aa  804    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  57.74 
 
 
406 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.48 
 
 
393 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.94 
 
 
393 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.01 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  56.54 
 
 
401 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  56.61 
 
 
401 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.61 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.12 
 
 
393 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  55.44 
 
 
405 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  55.44 
 
 
405 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.81 
 
 
402 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  49.6 
 
 
420 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.62 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  45.5 
 
 
425 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  45.34 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.47 
 
 
412 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  44.73 
 
 
420 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.47 
 
 
412 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  44.21 
 
 
412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.21 
 
 
412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.21 
 
 
412 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.21 
 
 
451 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.95 
 
 
412 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.95 
 
 
412 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.95 
 
 
412 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.95 
 
 
412 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.6 
 
 
413 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.12 
 
 
413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  45.09 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  46.3 
 
 
429 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  45.12 
 
 
424 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  42.74 
 
 
415 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.09 
 
 
400 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.49 
 
 
413 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.09 
 
 
404 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.56 
 
 
413 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  44.06 
 
 
413 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.42 
 
 
415 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  43.95 
 
 
440 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.84 
 
 
434 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.09 
 
 
404 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  44.18 
 
 
414 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.3 
 
 
416 aa  296  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  45.38 
 
 
411 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.8 
 
 
400 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.8 
 
 
404 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.8 
 
 
404 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.92 
 
 
410 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  44.25 
 
 
411 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  44.25 
 
 
411 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  44.47 
 
 
440 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  44.85 
 
 
411 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.19 
 
 
403 aa  289  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.57 
 
 
413 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  43.65 
 
 
417 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  42.39 
 
 
414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.06 
 
 
426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  44.13 
 
 
412 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  39.33 
 
 
422 aa  282  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  42.39 
 
 
417 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.57 
 
 
425 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.29 
 
 
419 aa  269  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.29 
 
 
419 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.47 
 
 
393 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  41.79 
 
 
416 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  43.75 
 
 
419 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.65 
 
 
418 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.5 
 
 
412 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  42.11 
 
 
403 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.26 
 
 
425 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  40.26 
 
 
433 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.69 
 
 
413 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.67 
 
 
411 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.95 
 
 
430 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  42.3 
 
 
326 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.62 
 
 
395 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.38 
 
 
412 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.11 
 
 
395 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.32 
 
 
392 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.97 
 
 
420 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.01 
 
 
413 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.67 
 
 
418 aa  212  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  37.89 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.89 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.63 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  39.3 
 
 
403 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3173  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.69 
 
 
415 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.203103  normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.64 
 
 
410 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1377  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.62 
 
 
409 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0469267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  37.98 
 
 
411 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.98 
 
 
411 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.98 
 
 
411 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3110  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.79 
 
 
375 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  30.77 
 
 
412 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.88 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1241  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  32.61 
 
 
405 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837587  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.61 
 
 
405 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3368  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.75 
 
 
375 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.43 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>