32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0029 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0036  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  96.93 
 
 		 651 aa  1283    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.844727  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0029  relaxase/mobilization nuclease MobA, putative  100 
 
 		 650 aa  1346    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1093  relaxase/mobilization nuclease domain protein  28.88 
 
 		 805 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246621  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0074  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  33.56 
 
 		 899 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0174778 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0058  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  33.33 
 
 		 899 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0607238  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0072  hypothetical protein  38.34 
 
 		 657 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385572 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3557  relaxase/mobilization nuclease family protein  27.57 
 
 		 635 aa  146  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58608  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4315  conjugal transfer relaxase TraI  26.37 
 
 		 752 aa  130  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4671  conjugal transfer relaxase TraI  24.32 
 
 		 713 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2249  conjugal transfer relaxase TraI  32.03 
 
 		 830 aa  124  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3574  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  31.38 
 
 		 743 aa  120  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0026  conjugal transfer relaxase TraI  25.66 
 
 		 873 aa  120  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771366  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6526  conjugal transfer relaxase TraI  26.2 
 
 		 746 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439323  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6611  conjugal transfer relaxase TraI  26.39 
 
 		 746 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0766  Relaxase/mobilization nuclease family protein  24.36 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4982  relaxase/mobilization nuclease family protein  26.25 
 
 		 843 aa  94  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2322  relaxase/mobilization nuclease family protein  31.19 
 
 		 303 aa  87  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2533  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.52 
 
 		 659 aa  84.7  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0373  traI protein, putative  31.9 
 
 		 650 aa  68.6  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2790  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  41.98 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2797  relaxase/mobilization nuclease domain-containing protein  35.56 
 
 		 398 aa  57  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7068  Relaxase/mobilization nuclease family protein  40.79 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003243  type IV secretory pathway VirD2 component  27.83 
 
 		 443 aa  51.2  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.403709  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5445  Relaxase/mobilization nuclease family protein  30.39 
 
 		 306 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.201668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2839  hypothetical protein  28.79 
 
 		 208 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0150  Cpp17  29.03 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000847879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3874  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.12 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2475  Relaxase/mobilization nuclease family protein  27.12 
 
 		 392 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0661835 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4540  Relaxase/mobilization nuclease family protein  29.23 
 
 		 464 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.727703 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5344  relaxase/mobilization nuclease family protein  25.81 
 
 		 279 aa  44.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1709  Relaxase/mobilization nuclease family protein  28.44 
 
 		 438 aa  43.9  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7564  relaxase/mobilization nuclease family protein  24.92 
 
 		 1019 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0784017  normal  0.290124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>