43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2124 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  100 
 
 
319 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4032  chlorinating enzyme  80.7 
 
 
319 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3490  chlorinating enzyme  80.38 
 
 
331 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2589  chlorinating enzyme  62.54 
 
 
332 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205565  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2610  chlorinating enzyme  60.98 
 
 
310 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0249054  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  58.17 
 
 
308 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  58.17 
 
 
308 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  56.39 
 
 
354 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  56.39 
 
 
352 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  56.39 
 
 
307 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  56.39 
 
 
307 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  52.48 
 
 
309 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3783  hypothetical protein  48.38 
 
 
311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0122615 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  45 
 
 
301 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  45 
 
 
301 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  45 
 
 
301 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  45 
 
 
301 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  40.4 
 
 
296 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.76 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.33 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.56 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.83 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.75 
 
 
276 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  24.07 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3102  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.15 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.02 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.66 
 
 
299 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.4 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.99 
 
 
253 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.81 
 
 
274 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.54 
 
 
372 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.63 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.87 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.35 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  28.47 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.57 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.14 
 
 
260 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.18 
 
 
261 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  24.44 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.78 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.39 
 
 
282 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.89 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>