34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2108 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  94.41 
 
 		 143 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  88.11 
 
 		 143 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  65.73 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  44.2 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  42.34 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  40.13 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  42.03 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  39.37 
 
 		 236 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  39.86 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  38.26 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  31.82 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  31.71 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  31.2 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  36.56 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.86 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  42.62 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 		 341 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  48.89 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  31.88 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 246 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.55 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  35.8 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  36.14 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  36.14 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  30.89 
 
 		 513 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  41.51 
 
 		 347 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  42.86 
 
 		 356 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  32.58 
 
 		 355 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  36.49 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  36.36 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  40.74 
 
 		 224 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5086  protein of unknown function DUF882  38.81 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.25036 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  37.29 
 
 		 421 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>