246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_39066 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  100 
 
 
151 aa  311  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  46.62 
 
 
138 aa  134  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  46.4 
 
 
133 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  46.22 
 
 
129 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  48.74 
 
 
132 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  49.58 
 
 
132 aa  121  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  45.53 
 
 
388 aa  120  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  44.07 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  45.6 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  45.6 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  45.6 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  45.6 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  45.6 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  45.6 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  41.61 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  54.13 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  45.6 
 
 
132 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  41.94 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  38.93 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  46.9 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  42.42 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  44.8 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  50 
 
 
135 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  47.24 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  44.26 
 
 
132 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  44.26 
 
 
132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  40.6 
 
 
135 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  44.92 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  46.46 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  42.4 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  44.44 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  45.24 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  42.52 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  50 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  47.15 
 
 
131 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  47.37 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  45.53 
 
 
132 aa  110  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  46.34 
 
 
131 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  42.75 
 
 
143 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  47.22 
 
 
138 aa  108  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  40.31 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  45.83 
 
 
129 aa  107  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  41.67 
 
 
126 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  42.4 
 
 
142 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  44.74 
 
 
129 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  40.3 
 
 
139 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  41.09 
 
 
132 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  41.22 
 
 
131 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  43.18 
 
 
181 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  47.93 
 
 
129 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  48.8 
 
 
136 aa  104  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  40.62 
 
 
133 aa  104  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  41.61 
 
 
139 aa  103  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  40.8 
 
 
134 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  43.86 
 
 
135 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  40.8 
 
 
134 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  40.83 
 
 
136 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  44 
 
 
130 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  42.62 
 
 
129 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  43.44 
 
 
129 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  44.74 
 
 
135 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  41.94 
 
 
132 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  40.8 
 
 
134 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  41.91 
 
 
139 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  43.8 
 
 
135 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  40.6 
 
 
138 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  42.75 
 
 
138 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05460  cytidine deaminase  43.62 
 
 
160 aa  100  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  44.64 
 
 
582 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  44.92 
 
 
120 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  37.82 
 
 
132 aa  99.4  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  39.2 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  40.48 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  40.98 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  43.93 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  40.98 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  40.98 
 
 
129 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  42.59 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  45.05 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  43.81 
 
 
129 aa  97.1  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  40.31 
 
 
301 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  41.32 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  44.44 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  39.53 
 
 
160 aa  94.4  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  44.44 
 
 
231 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3193  cytidine deaminase  45.95 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0570235  normal  0.552926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  38.28 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  41.44 
 
 
136 aa  94.4  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  44.44 
 
 
130 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>