More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30246 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  100 
 
 
358 aa  733    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.09 
 
 
334 aa  227  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.18 
 
 
333 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.26 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1883  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.71 
 
 
346 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  35.26 
 
 
350 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
333 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.67 
 
 
343 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.01 
 
 
346 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
347 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
348 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
348 aa  212  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  38.55 
 
 
333 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
343 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.54 
 
 
351 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.63 
 
 
333 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  37.46 
 
 
334 aa  209  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
347 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.39 
 
 
333 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
348 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.39 
 
 
333 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.82 
 
 
335 aa  207  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  36.1 
 
 
352 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
350 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.72 
 
 
348 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
348 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.24 
 
 
348 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0771  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
353 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000114333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.2 
 
 
347 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.24 
 
 
351 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.21 
 
 
335 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.68 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
359 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1770  alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
352 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.869805  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3298  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00280  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  34.57 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00284  hypothetical protein  34.57 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.29 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0390  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.57 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0349  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.57 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.91 
 
 
348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0396  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.57 
 
 
349 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.86 
 
 
349 aa  200  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.73 
 
 
349 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.29 
 
 
349 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0356  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  36.29 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.799512  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
348 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.1 
 
 
353 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 
348 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.47 
 
 
339 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.45 
 
 
352 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
350 aa  196  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36 
 
 
349 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.63 
 
 
354 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6824  alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
350 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
352 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.53 
 
 
346 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.15 
 
 
351 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.66 
 
 
352 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.31 
 
 
348 aa  192  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
349 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  33.33 
 
 
346 aa  192  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.17 
 
 
352 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.2 
 
 
347 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.2 
 
 
350 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
350 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
350 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
350 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
348 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
350 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
353 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.56 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1553  alcohol dehydrogenase  37.42 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.63 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
350 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.33 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  35.34 
 
 
350 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.33 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.33 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.87 
 
 
350 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.63 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.33 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.43 
 
 
353 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.84 
 
 
351 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  34.68 
 
 
350 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  35.33 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.48 
 
 
338 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
352 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.83 
 
 
347 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
349 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1098  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.39 
 
 
361 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>