More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24935 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24935  helicase_1  100 
 
 
455 aa  938    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  51.93 
 
 
474 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43135  predicted protein  49.1 
 
 
587 aa  347  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  43.56 
 
 
545 aa  280  5e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05150  conserved hypothetical protein  37 
 
 
606 aa  253  6e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00220  RNA helicase, putative  41.24 
 
 
710 aa  234  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.063496  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  38.01 
 
 
607 aa  232  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  36.49 
 
 
589 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  38.67 
 
 
485 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  37.89 
 
 
609 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  35.7 
 
 
567 aa  220  5e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  34.29 
 
 
567 aa  220  5e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00894  DEAD box RNA helicase HelA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15620)  36.13 
 
 
641 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.859671  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  38.06 
 
 
528 aa  210  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.2 
 
 
498 aa  210  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  39.94 
 
 
627 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.7 
 
 
511 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  36.89 
 
 
398 aa  206  9e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  36.86 
 
 
765 aa  205  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.7 
 
 
571 aa  206  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.8 
 
 
530 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  36.16 
 
 
445 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.15 
 
 
571 aa  204  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  36.73 
 
 
812 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.11 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  35.11 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  35.11 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  35.11 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.11 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.11 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.09 
 
 
473 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.11 
 
 
525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.47 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.07 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35.11 
 
 
525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.08 
 
 
522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  35.87 
 
 
481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  36.05 
 
 
579 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  34.57 
 
 
529 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.22 
 
 
545 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
526 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
525 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
525 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.34 
 
 
515 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.03 
 
 
418 aa  199  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.95 
 
 
538 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  36.8 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  34.95 
 
 
559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.27 
 
 
418 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.83 
 
 
485 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.83 
 
 
485 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  34.83 
 
 
485 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.83 
 
 
485 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  34.83 
 
 
485 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.09 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.09 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.86 
 
 
479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.69 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.55 
 
 
578 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.55 
 
 
577 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  35.09 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.83 
 
 
482 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  34.56 
 
 
484 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  36.13 
 
 
418 aa  195  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1767  DEAD/DEAH box helicase-like  35.51 
 
 
540 aa  195  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.5 
 
 
425 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  35.04 
 
 
485 aa  195  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 
480 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 
480 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.64 
 
 
466 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.65 
 
 
598 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.05 
 
 
678 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.92 
 
 
467 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2698  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  35.44 
 
 
473 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 
479 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.41 
 
 
591 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0754  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.26 
 
 
447 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0016093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.54 
 
 
482 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.69 
 
 
474 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.54 
 
 
482 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.84 
 
 
439 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.1 
 
 
571 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  34.65 
 
 
574 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  35.54 
 
 
482 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  35.54 
 
 
482 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  35.54 
 
 
482 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  35.54 
 
 
481 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 
581 aa  194  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35 
 
 
601 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.66 
 
 
493 aa  193  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.69 
 
 
447 aa  193  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2088  putative ATP-dependent RNA helicase 1  33.6 
 
 
453 aa  193  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.936977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  34.31 
 
 
494 aa  192  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1851  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.54 
 
 
417 aa  192  8e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05215  putative ATP-dependent RNA helicase  35.71 
 
 
424 aa  192  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.190417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.83 
 
 
463 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.51 
 
 
565 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  34.2 
 
 
435 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.4 
 
 
463 aa  192  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>