256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2028 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2028  ebsC protein  100 
 
 		 169 aa  348  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0170  ybaK/ebsC protein  52.41 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  50 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  50.34 
 
 		 158 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  49.67 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  51.03 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  48.75 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1631  YbaK/ebsC protein  49.65 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  48.99 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1356  ybaK/ebsC protein  43.14 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00173308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  46.85 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  46.41 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0622  ybaK/ebsC protein  44.9 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966718  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1378  YbaK/ebsC protein  47.22 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0222157  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  46.67 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08460  ybaK/ebsC protein  48.59 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.466447  normal  0.283555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1566  ybaK/ebsC protein  42.96 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0327966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3328  ybaK/ebsC family protein  41.22 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3350  ybaK/ebsC family protein  41.89 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3222  ybaK/ebsC protein  45.95 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3116  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1903  ybaK/ebsC family protein  41.22 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3347  ybaK/ebsC family protein  41.22 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.297019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3129  ybaK/ebsC family protein  41.89 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3375  ybaK/ebsC family protein  41.89 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3353  ybaK/ebsC family protein  41.22 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.261499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3021  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3053  ybaK/ebsC protein  41.89 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  42.07 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  42.07 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0105  YbaK/ebsC protein  40.82 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0583  ybaK/ebsC protein  39.46 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  35.71 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1957  ybaK/ebsC protein  46.1 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000134669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1609  ybaK/prolyl-tRNA synthetases associated domain-containing protein  44.66 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0985663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  39.72 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02442  ybaK/ebsC protein  37.93 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00512118  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  35.85 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1461  ybaK/ebsC protein  34.46 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1348  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.24 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0192059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  39.74 
 
 		 155 aa  94  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  41.26 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.58 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  34.19 
 
 		 155 aa  91.3  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  40.14 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1741  ybaK/ebsC protein  37.76 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0625  ybaK/ebsC protein  42.86 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0361405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  39.44 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  39.01 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  40.13 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  38.84 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2948  ybaK/ebsC protein  37.06 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  37.74 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  37.41 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  39.29 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  37.06 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  35.66 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  40.43 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  41.74 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0740  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  37.2 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  39.29 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  41.23 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  36.88 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004197  transcriptional regulator  40.13 
 
 		 157 aa  84.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  38.41 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1563  hypothetical protein  38.41 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0021  YbaK/EbsC protein  34.51 
 
 		 155 aa  84.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  35.8 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1688  ybaK/ebsC protein  35.67 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  35.26 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  35.26 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  35.26 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  35.26 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  35.26 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  36.69 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  38.97 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0358  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  36.55 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  36 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  36.36 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0753  ebsC family protein, putative  33.97 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  36.36 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1401  ybaK/ebsC protein  34.27 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000538282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  37.33 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  38.26 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10700  ybaK/ebsC protein  34.48 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00787885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  38.22 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2585  ybaK/ebsC protein  35.14 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  36.23 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  35.83 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  35.66 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>