More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0141 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  100 
 
 
289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  47.35 
 
 
307 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  50.18 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  47.53 
 
 
304 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  44.44 
 
 
303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  43.24 
 
 
306 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  45.15 
 
 
302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  43.56 
 
 
310 aa  239  5e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  46.98 
 
 
279 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  46.62 
 
 
279 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  45.04 
 
 
283 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.82 
 
 
282 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  229  5e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  46.15 
 
 
289 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  43.66 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  43.19 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  41.69 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  39.29 
 
 
323 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  44.41 
 
 
294 aa  216  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  43.66 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  41.83 
 
 
304 aa  212  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.43 
 
 
286 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  44.25 
 
 
297 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  42.41 
 
 
282 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  41.28 
 
 
294 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  41.12 
 
 
305 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  41.64 
 
 
295 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  40.54 
 
 
298 aa  209  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  41.14 
 
 
296 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  42.25 
 
 
272 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  42.32 
 
 
312 aa  205  8e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  40.74 
 
 
295 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  39.26 
 
 
312 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  40.44 
 
 
295 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.2 
 
 
279 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  39.15 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  39.7 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  42.75 
 
 
422 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  42.66 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  38.79 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  46.23 
 
 
287 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  38.52 
 
 
283 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  36.54 
 
 
298 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  40.46 
 
 
305 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  38.43 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  38.79 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  45.91 
 
 
269 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  39.09 
 
 
310 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40.85 
 
 
285 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  38.79 
 
 
283 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  40 
 
 
298 aa  198  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  38.79 
 
 
283 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  41.13 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  40.27 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  38.57 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  41.15 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  39.05 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  38.95 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  41.34 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  37.84 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.57 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.41 
 
 
289 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  40.98 
 
 
379 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  38.08 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  39.64 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  39.62 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  40.35 
 
 
281 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  39.86 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  39.86 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  39.86 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  39.86 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  39.86 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  39.86 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  38.79 
 
 
283 aa  195  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  39.86 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  41.67 
 
 
331 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.02 
 
 
288 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  39.59 
 
 
289 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.02 
 
 
290 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  40.77 
 
 
331 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.06 
 
 
295 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  38.64 
 
 
377 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  39.18 
 
 
297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  38.03 
 
 
283 aa  194  2e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  39.93 
 
 
297 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  37.79 
 
 
301 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  37.97 
 
 
319 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  39.18 
 
 
297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  37.67 
 
 
294 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  38.62 
 
 
294 aa  193  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  39.18 
 
 
305 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  39.18 
 
 
305 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  39.18 
 
 
295 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  40.3 
 
 
529 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  42.37 
 
 
298 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  42.37 
 
 
298 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  39.24 
 
 
286 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  40.66 
 
 
317 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  38.54 
 
 
288 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  39.45 
 
 
286 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>