More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3705 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
110 aa  221  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  78.12 
 
 
100 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  78.12 
 
 
100 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  63.27 
 
 
105 aa  127  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  9.21122e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  57 
 
 
101 aa  120  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  60.82 
 
 
100 aa  118  2e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  58 
 
 
104 aa  117  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  56.31 
 
 
104 aa  115  2e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  52.04 
 
 
103 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  52.04 
 
 
103 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  55.43 
 
 
97 aa  106  9e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  52.58 
 
 
100 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  54.95 
 
 
100 aa  104  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  54.95 
 
 
100 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
100 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
100 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  53.06 
 
 
100 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 
100 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  54.44 
 
 
94 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  52.13 
 
 
95 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  6.05336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
95 aa  93.6  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.50147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 
94 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  55.95 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  55.95 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  52.33 
 
 
94 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  55.95 
 
 
98 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 
96 aa  87.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  47.83 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  45.98 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  2.10962e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 
98 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 
94 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  6.52343e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 
93 aa  85.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  6.79303e-05  hitchhiker  1.53425e-10 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.1109e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  44.83 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.27953e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  4.09295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  45.65 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.40996e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  44.83 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.64247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 
97 aa  83.2  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 
96 aa  83.2  1e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  48.35 
 
 
98 aa  83.6  1e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 
97 aa  82.4  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  50.62 
 
 
98 aa  82.4  2e-15  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  51.19 
 
 
96 aa  81.6  3e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  45.05 
 
 
95 aa  81.6  3e-15  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  3.56611e-09 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  43.96 
 
 
95 aa  82  3e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  1.09599e-08 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.56 
 
 
95 aa  81.6  3e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 
98 aa  81.6  3e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 
97 aa  81.3  4e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
98 aa  81.3  4e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
100 aa  80.9  5e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 
97 aa  80.9  6e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 
95 aa  80.9  6e-15  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  46.32 
 
 
93 aa  80.5  8e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
98 aa  79.7  1e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 
101 aa  79.7  1e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
98 aa  80.1  1e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 
99 aa  80.1  1e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 
98 aa  79.7  1e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 
98 aa  79.7  1e-14  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.28717e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 
94 aa  80.1  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  43.33 
 
 
98 aa  79  2e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  47.78 
 
 
99 aa  79  2e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 
97 aa  79.3  2e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.79883e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 
97 aa  79.3  2e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
99 aa  79  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 
98 aa  79.3  2e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  44.23 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 
100 aa  78.2  3e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  53.57 
 
 
103 aa  78.6  3e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  46.43 
 
 
96 aa  78.6  3e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  52.75 
 
 
99 aa  78.6  3e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 
99 aa  78.2  3e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  46.15 
 
 
101 aa  77.8  4e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
97 aa  77.8  4e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 
97 aa  77.8  4e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 
101 aa  77.4  6e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  43.9 
 
 
96 aa  77.4  6e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  2.07631e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  49.45 
 
 
99 aa  77  7e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  47.25 
 
 
100 aa  77  8e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  47.19 
 
 
99 aa  77  8e-14  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  2.5981e-07  hitchhiker  4.76583e-07 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  48.39 
 
 
101 aa  77  8e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  5.94054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  77  9e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.42276e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
97 aa  77  9e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.43862e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  47.31 
 
 
98 aa  76.3  1e-13  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  51.19 
 
 
98 aa  76.3  1e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  45.24 
 
 
96 aa  76.3  1e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  43.53 
 
 
101 aa  76.3  1e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  43.9 
 
 
96 aa  76.6  1e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.44838e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>