263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3612 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  97.13 
 
 		 244 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  64.73 
 
 		 246 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  56.9 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  46.82 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  43.86 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  45.78 
 
 		 293 aa  201  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  43.36 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  44.44 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  44.44 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  44.44 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  46.92 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  46.92 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  44.44 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  42.48 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  41.35 
 
 		 238 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  46.92 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  41.48 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  40.36 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  41.56 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  41.56 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  41.45 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  45.5 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  42.24 
 
 		 232 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  43.52 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  42.06 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  42.79 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  39.65 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  35.42 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.47 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  30.62 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  32.02 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  33.15 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  30.43 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  32.58 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  30.43 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  29.5 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  33.33 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  29.06 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  28.92 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  29.06 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  28.06 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  28.12 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  28.06 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  30.9 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  30.17 
 
 		 228 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  31.38 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  31.38 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  31.38 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  31.38 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  31.38 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  31.38 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  30.85 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  29.12 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  30.85 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  31.14 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  30.85 
 
 		 241 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  27.08 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  28.65 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3946  AzlC family protein  29.25 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  28.95 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  29.73 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  32.4 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  27.39 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  25.29 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  28.02 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  27.27 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  27.59 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  27.98 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  29.8 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.02 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3747  AzlC family protein  25.51 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.271114 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  31.63 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  26.98 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  29.35 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  28.33 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  29.78 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  30.46 
 
 		 313 aa  87  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  25.27 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.02 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  27.46 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  27.72 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  27.46 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  26.63 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  31.14 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  24.07 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  25.91 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  30.12 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  24.07 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  24.07 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  28.16 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  24 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  24.77 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3169  AzlC family protein  26.67 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  27.49 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  26.52 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  27.59 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  30 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  25.11 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  26.56 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>