40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  97.88 
 
 		 236 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  52.12 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  50.85 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  49.17 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  49.77 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  49.77 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  49.32 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  50.67 
 
 		 241 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  48.86 
 
 		 214 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  49.11 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  26.82 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.88 
 
 		 201 aa  72  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.53 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.37 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.34 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.23 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  26.09 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32.38 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.57 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  27.86 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  26.95 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  27.75 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  23.71 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  25 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  26.39 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  23.71 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23.46 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  23.7 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  24.5 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  26.06 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.89 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  25.18 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  23.57 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  27.53 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  26 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  25.52 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  22.99 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>