40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  97.88 
 
 
236 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  52.12 
 
 
232 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  50.85 
 
 
231 aa  232  4e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  49.17 
 
 
237 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  49.77 
 
 
251 aa  220  1e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  49.77 
 
 
251 aa  220  2e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  49.32 
 
 
236 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  50.67 
 
 
241 aa  214  6e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  48.86 
 
 
214 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  49.11 
 
 
242 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  26.82 
 
 
204 aa  74.7  1e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.88 
 
 
201 aa  72  8e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.53 
 
 
204 aa  66.6  3e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.37 
 
 
212 aa  63.9  2e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.34 
 
 
205 aa  62  8e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.23 
 
 
203 aa  60.8  2e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  26.09 
 
 
197 aa  60.1  3e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32.38 
 
 
197 aa  59.7  4e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.57 
 
 
195 aa  58.9  7e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  27.86 
 
 
200 aa  57.8  1e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  26.95 
 
 
188 aa  55.8  5e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  27.75 
 
 
192 aa  55.1  9e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  23.71 
 
 
198 aa  55.1  1e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  25 
 
 
196 aa  53.5  3e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  23.71 
 
 
199 aa  51.2  1e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  26.39 
 
 
201 aa  51.2  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  48.9  8e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  23.46 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  23.7 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  24.5 
 
 
189 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  26.06 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  28.89 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  25.18 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  23.57 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  27.53 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  26 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  25.52 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  22.99 
 
 
202 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>