100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  465  1e-130  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  90.99 
 
 
233 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  54.74 
 
 
222 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  54.31 
 
 
231 aa  244  1e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  54.94 
 
 
231 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  54.94 
 
 
245 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  55.27 
 
 
242 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  53.59 
 
 
216 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  50.48 
 
 
214 aa  224  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  53.05 
 
 
218 aa  221  5e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  50.74 
 
 
214 aa  215  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  50.61 
 
 
256 aa  215  6e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  54.15 
 
 
211 aa  205  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  1.23908e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  54.15 
 
 
211 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  54.15 
 
 
211 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  52.11 
 
 
218 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  48.57 
 
 
230 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  48.1 
 
 
230 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  48.1 
 
 
230 aa  189  3e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  48.57 
 
 
230 aa  189  3e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  47.85 
 
 
217 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  44.98 
 
 
233 aa  174  1e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  45.93 
 
 
221 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  45.93 
 
 
217 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  45.19 
 
 
217 aa  162  4e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  35.32 
 
 
206 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  31.86 
 
 
209 aa  128  7e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  32.35 
 
 
206 aa  126  4e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  37.11 
 
 
210 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  34.9 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  38.19 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
210 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 
210 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  33.51 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  38.1 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  37.93 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 
210 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.46 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  35.2 
 
 
210 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  37.97 
 
 
199 aa  84.7  1e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  29.17 
 
 
207 aa  82.4  6e-15  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  34.54 
 
 
210 aa  80.5  2e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  31.66 
 
 
210 aa  80.1  3e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  34 
 
 
259 aa  80.1  3e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  31.61 
 
 
228 aa  80.1  3e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  31.61 
 
 
228 aa  80.1  3e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  31.61 
 
 
249 aa  79.7  3e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  31.61 
 
 
228 aa  80.1  3e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  31.61 
 
 
228 aa  80.1  3e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  31.61 
 
 
225 aa  80.1  3e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  31.61 
 
 
228 aa  80.1  3e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  27.09 
 
 
238 aa  79  5e-14  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  26.6 
 
 
242 aa  79.3  5e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  29 
 
 
214 aa  79.3  5e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  27.78 
 
 
242 aa  76.6  3e-13  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  34.22 
 
 
199 aa  76.6  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  26.9 
 
 
208 aa  76.6  3e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.90995e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  40.14 
 
 
221 aa  76.3  4e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  32.67 
 
 
221 aa  75.9  5e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  31.98 
 
 
217 aa  75.9  5e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  31.68 
 
 
221 aa  73.9  2e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  27.13 
 
 
209 aa  73.2  3e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  24.87 
 
 
206 aa  73.2  3e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  29.17 
 
 
212 aa  71.6  9e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  30.69 
 
 
221 aa  70.1  3e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  32.54 
 
 
218 aa  68.9  6e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  26.97 
 
 
208 aa  67  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  26.05 
 
 
223 aa  66.6  3e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  25.52 
 
 
200 aa  66.6  3e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  25.39 
 
 
209 aa  66.6  3e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  30.05 
 
 
221 aa  64.7  1e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  24.47 
 
 
207 aa  65.1  1e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  28.91 
 
 
244 aa  64.7  1e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.73657e-07  hitchhiker  1.78225e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  26.78 
 
 
207 aa  59.7  3e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.09 
 
 
209 aa  58.5  8e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  4.72775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 
300 aa  56.6  3e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  24.27 
 
 
206 aa  55.5  7e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  22.68 
 
 
213 aa  55.5  7e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  24.04 
 
 
206 aa  55.1  9e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  26.29 
 
 
208 aa  54.7  1e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.39 
 
 
206 aa  52.8  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  9.30867e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.86 
 
 
305 aa  52.8  5e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  7.56973e-05  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  23.28 
 
 
206 aa  52.8  5e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.58373e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
303 aa  51.2  1e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  29.44 
 
 
210 aa  49.7  4e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  24.86 
 
 
198 aa  49.3  5e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
215 aa  48.9  6e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  30.4 
 
 
215 aa  48.5  9e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.87 
 
 
336 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  21.82 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  23.15 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  27.13 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  25.77 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2458  hypothetical protein  22.82 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.194182  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  38.82 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1552  hypothetical protein  21.83 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  42.47 
 
 
203 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>