66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_04571 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_04571  methylase  100 
 
 
251 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15901  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  54.37 
 
 
252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487038  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18701  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.22 
 
 
251 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1001  SAM dependent methyltransferase  46.22 
 
 
251 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0622  biotin biosynthesis protein BioC  48.37 
 
 
254 aa  230  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2050  biotin biosynthesis  44.08 
 
 
254 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.146243  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16501  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.75 
 
 
252 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16601  methylase  29.48 
 
 
256 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.203041  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1563  biotin synthesis protein BioC, putative  30.52 
 
 
256 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.88 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  31.62 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  26.3 
 
 
474 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  20.77 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  20.77 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  22.37 
 
 
253 aa  59.3  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  26.42 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  33.1 
 
 
267 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  26.79 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.01 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  24.54 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.17 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  22.92 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  28.37 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  21.92 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  21.14 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
309 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  24.6 
 
 
292 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  24.6 
 
 
292 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  23.58 
 
 
281 aa  48.9  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  25.71 
 
 
325 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  20.62 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  24.89 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  34.27 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  26.21 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  24.79 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.51 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  23.14 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.6 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  27.96 
 
 
262 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  33.09 
 
 
267 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3137  methyltransferase type 11  23.17 
 
 
256 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  33.57 
 
 
272 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  33.1 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  32.89 
 
 
272 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.8 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0081  biotin biosynthesis protein BioC  28.28 
 
 
261 aa  45.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  27.71 
 
 
315 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  25.93 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  24.65 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2921  methyltransferase type 11  22.44 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384761  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.98 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.94 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  22.54 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  20.85 
 
 
267 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  22.87 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  32.89 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  21.43 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0768  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  21.46 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.97 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  30.72 
 
 
249 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  23.89 
 
 
268 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  20.54 
 
 
264 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>