29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4314 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 412 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  57.64 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  44.04 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  43.61 
 
 		 1748 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  42.49 
 
 		 381 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  55.2 
 
 		 292 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  37.98 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  39.48 
 
 		 912 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  36.6 
 
 		 432 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  36.97 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  37.63 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.21 
 
 		 460 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 477 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  31.13 
 
 		 106 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.81 
 
 		 1152 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  25.35 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  24.9 
 
 		 1223 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  21.25 
 
 		 609 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  23.89 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  25.32 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  22.35 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  22.29 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  28.35 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  23.24 
 
 		 543 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  21.11 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  24.63 
 
 		 376 aa  43.1  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>