More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4165 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  100 
 
 
314 aa  642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  59.48 
 
 
334 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  53.99 
 
 
311 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  55.77 
 
 
314 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  55.77 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  56.41 
 
 
319 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  54.98 
 
 
331 aa  332  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  54.63 
 
 
310 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  54.25 
 
 
309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  54.98 
 
 
336 aa  324  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  54.84 
 
 
311 aa  322  7e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  52.77 
 
 
320 aa  321  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  53.38 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  55.77 
 
 
314 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  54.37 
 
 
335 aa  315  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  53.7 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  52.27 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  51.78 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  51.94 
 
 
311 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
311 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  51.92 
 
 
330 aa  311  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  55.34 
 
 
314 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  53.05 
 
 
325 aa  310  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  53.53 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  53.53 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  53.53 
 
 
333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  51.61 
 
 
311 aa  309  4e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
310 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  53.8 
 
 
320 aa  306  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  52.12 
 
 
348 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  51.95 
 
 
318 aa  305  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  50.33 
 
 
333 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  50 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  51.91 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_002950  PG1134  thioredoxin reductase  51.46 
 
 
313 aa  301  7.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.788555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  54.29 
 
 
317 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  47.94 
 
 
323 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  51.48 
 
 
332 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3641  Thioredoxin-disulfide reductase  49.69 
 
 
357 aa  300  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119542  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  49.35 
 
 
318 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  51.79 
 
 
320 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  53.33 
 
 
362 aa  298  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  52.26 
 
 
348 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  51.82 
 
 
319 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  53.7 
 
 
309 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
311 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1354  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
313 aa  296  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
318 aa  295  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
334 aa  295  5e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
346 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  50.31 
 
 
458 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  47.12 
 
 
308 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  48.72 
 
 
320 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
345 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  50.32 
 
 
353 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  51.3 
 
 
359 aa  292  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11253  putative thioredoxin reductase  47.66 
 
 
326 aa  292  6e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  50.48 
 
 
315 aa  291  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  51.12 
 
 
318 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  48.25 
 
 
453 aa  290  3e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  48.39 
 
 
320 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  48.2 
 
 
327 aa  289  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  48.39 
 
 
320 aa  289  4e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  49.51 
 
 
322 aa  289  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  49.37 
 
 
460 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  51.12 
 
 
327 aa  288  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  49.52 
 
 
332 aa  288  7e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  48.38 
 
 
311 aa  286  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  45.78 
 
 
314 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  51.15 
 
 
321 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0199  thioredoxin reductase  49.04 
 
 
315 aa  287  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  51.13 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  51.96 
 
 
325 aa  285  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  50.49 
 
 
321 aa  285  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  48.23 
 
 
317 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  51.14 
 
 
334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  51.45 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  49.03 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  50.81 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  46.73 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0375  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2343  thioredoxin reductase  47.34 
 
 
461 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  47.45 
 
 
547 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  48.88 
 
 
456 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  49.84 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2394  thioredoxin reductase  47.34 
 
 
461 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  50.16 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  50 
 
 
317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  50 
 
 
312 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  49.19 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  50.97 
 
 
314 aa  281  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0735  thioredoxin-disulfide reductase  46.96 
 
 
318 aa  281  1e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  49.84 
 
 
321 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01260  thioredoxin-disulfide reductase, putative  49.06 
 
 
371 aa  280  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  50 
 
 
312 aa  280  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  48.4 
 
 
316 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  48.08 
 
 
316 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>