53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1054 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  579  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  43.84 
 
 
298 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  43.19 
 
 
216 aa  173  3e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  43.12 
 
 
254 aa  165  7e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  33.9 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  42.02 
 
 
356 aa  82.4  8e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  32.57 
 
 
241 aa  82  9e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  34.53 
 
 
364 aa  77.4  2e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  32.79 
 
 
260 aa  77.8  2e-13  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  35.33 
 
 
336 aa  72  1e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  33.87 
 
 
358 aa  68.2  1e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  30.4 
 
 
266 aa  67  4e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  27.23 
 
 
265 aa  66.2  5e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  29.31 
 
 
257 aa  63.9  3e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  28.29 
 
 
251 aa  62.8  7e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  30.19 
 
 
255 aa  62.4  8e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  26.69 
 
 
246 aa  62  1e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  32.45 
 
 
262 aa  61.2  2e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  30.32 
 
 
271 aa  59.7  5e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  30.32 
 
 
271 aa  59.7  5e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  30.32 
 
 
271 aa  59.3  7e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  57.8  2e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  31.82 
 
 
262 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  31.17 
 
 
254 aa  55.8  7e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  31.17 
 
 
254 aa  55.8  8e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  28.75 
 
 
256 aa  55.8  8e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  32.14 
 
 
271 aa  55.8  8e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  29.68 
 
 
270 aa  55.8  8e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  29.33 
 
 
258 aa  55.5  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  29.68 
 
 
270 aa  55.1  1e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  29.66 
 
 
281 aa  55.5  1e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  27.9 
 
 
263 aa  54.3  2e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  29.68 
 
 
270 aa  53.9  3e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  30.13 
 
 
270 aa  53.9  3e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  34.57 
 
 
263 aa  52.8  7e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  52.4  8e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  52.4  8e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  52.4  8e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  52.4  8e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  52.4  8e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  52.4  9e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  32.1 
 
 
260 aa  51.6  1e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  52  1e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  34.15 
 
 
263 aa  52  1e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  35.14 
 
 
237 aa  50.8  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  32.1 
 
 
260 aa  50.8  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  28.67 
 
 
260 aa  50.1  4e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  37.04 
 
 
270 aa  49.7  6e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  26.14 
 
 
264 aa  49.3  7e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  33.01 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  34.15 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  26.97 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  28.09 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>