267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1123 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  39.06 
 
 
214 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  41.62 
 
 
280 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  39.71 
 
 
626 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  40.24 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  41.4 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  34.11 
 
 
229 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  37.99 
 
 
190 aa  132  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  40.61 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.39 
 
 
213 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  35.56 
 
 
224 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  38.55 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  32.34 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  33.15 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  33.65 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  34.05 
 
 
212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  42.35 
 
 
194 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  34.05 
 
 
221 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  33.16 
 
 
246 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  32.7 
 
 
212 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  39.76 
 
 
226 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1337  precorrin-2 dehydrogenase  40.27 
 
 
205 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1310  precorrin-2 dehydrogenase  40.27 
 
 
205 aa  121  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1311  precorrin-2 dehydrogenase  40.27 
 
 
205 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1447  precorrin-2 dehydrogenase  40.27 
 
 
205 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1519  precorrin-2 dehydrogenase  40.27 
 
 
205 aa  121  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.71349e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  41.46 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  30.5 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1589  precorrin-2 dehydrogenase  40.27 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  33.69 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  34.04 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1551  precorrin-2 dehydrogenase  40.27 
 
 
205 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.710428  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  32.97 
 
 
255 aa  118  7e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  34.07 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  31.75 
 
 
489 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  28.37 
 
 
225 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1351  precorrin-2 dehydrogenase  38.26 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00349577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  38.26 
 
 
493 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  33.33 
 
 
218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0464  siroheme synthase  36.02 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142976  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0049  siroheme synthase  36.61 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  33.15 
 
 
198 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  32.65 
 
 
226 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  36.36 
 
 
306 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  32.23 
 
 
312 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  34.01 
 
 
200 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  36.36 
 
 
306 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  30.05 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  34.81 
 
 
221 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  34.81 
 
 
249 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  38.41 
 
 
224 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  27.32 
 
 
303 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  27.32 
 
 
303 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  27.32 
 
 
303 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  28.5 
 
 
225 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0537  siroheme synthase, N-terminal component  33.93 
 
 
321 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  27.53 
 
 
303 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  27.53 
 
 
303 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  27.53 
 
 
303 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  27.53 
 
 
303 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  27.42 
 
 
303 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.05 
 
 
481 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  30.29 
 
 
220 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.22 
 
 
464 aa  99  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  28.99 
 
 
303 aa  98.2  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  26.49 
 
 
303 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  29.65 
 
 
465 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0417  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.18 
 
 
462 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  29.65 
 
 
465 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  37.75 
 
 
149 aa  95.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.23 
 
 
484 aa  94.7  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  28.65 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  29.02 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2755  siroheme synthase  29.84 
 
 
314 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.600217  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1704  siroheme synthase  36.13 
 
 
152 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  30.05 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  30.25 
 
 
197 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  34.9 
 
 
800 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  28.22 
 
 
464 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.1 
 
 
502 aa  89.4  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  27.54 
 
 
303 aa  89  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  27.38 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  28.22 
 
 
464 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.85 
 
 
482 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1407  siroheme synthase  24.59 
 
 
307 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.18 
 
 
462 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  30.11 
 
 
474 aa  87  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0861  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.67 
 
 
472 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.402872  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1785  siroheme synthase  26.71 
 
 
151 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000034128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.98 
 
 
487 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2018  siroheme synthase  29.19 
 
 
476 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1941  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.61 
 
 
478 aa  86.3  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  28.88 
 
 
554 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1977  siroheme synthase CysG  29.89 
 
 
188 aa  85.9  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.769253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  36.8 
 
 
153 aa  85.1  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  24.19 
 
 
457 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.51 
 
 
410 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  26.63 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  27.64 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2427  siroheme synthase  31.29 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0405049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>