120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4413 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  100 
 
 
266 aa  528  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  56.5 
 
 
257 aa  279  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  56.91 
 
 
253 aa  279  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  55.24 
 
 
255 aa  262  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  51.82 
 
 
258 aa  259  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  47.64 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  47.64 
 
 
287 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  45.97 
 
 
283 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  45.42 
 
 
296 aa  215  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  46.12 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  47.62 
 
 
267 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  49.22 
 
 
300 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  44.36 
 
 
261 aa  208  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  49 
 
 
263 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  45.34 
 
 
281 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  45.77 
 
 
294 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  47.98 
 
 
260 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  44.35 
 
 
301 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  44.57 
 
 
262 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  42.42 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  49.2 
 
 
264 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  45.1 
 
 
326 aa  194  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  45.97 
 
 
265 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  44.22 
 
 
254 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  47.81 
 
 
319 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  44.27 
 
 
281 aa  188  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  46.22 
 
 
273 aa  188  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  46.51 
 
 
255 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  46.85 
 
 
259 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  44.62 
 
 
258 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  42.35 
 
 
258 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  43.08 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  41.18 
 
 
333 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  42.42 
 
 
290 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  41.83 
 
 
289 aa  168  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  42.98 
 
 
262 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  39.38 
 
 
307 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  41.18 
 
 
270 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  41.22 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.67 
 
 
258 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  38.67 
 
 
256 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  38.67 
 
 
256 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  37.11 
 
 
256 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  32.47 
 
 
196 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  31.77 
 
 
196 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  35.15 
 
 
210 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  30.73 
 
 
197 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  31.25 
 
 
197 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  30.21 
 
 
197 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  30.21 
 
 
211 aa  89  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  30.21 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  29.69 
 
 
211 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  29.17 
 
 
229 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  32.66 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  31.68 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  31.82 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  37.39 
 
 
143 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  32.32 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.65 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  31.71 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  26.96 
 
 
225 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.46 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  27.75 
 
 
202 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  28.57 
 
 
195 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  26.7 
 
 
205 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  26.26 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  29.89 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  30.46 
 
 
286 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  26.67 
 
 
204 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  29.81 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  30.46 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  28.8 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  28.85 
 
 
368 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  25.53 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  26.46 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  26.46 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  26.46 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  25.93 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  24.6 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  29.8 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  25.91 
 
 
195 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  25.93 
 
 
185 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  25.93 
 
 
216 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5194  GDSL family lipase  23.94 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5580  putative lipase/acylhydrolase  23.66 
 
 
269 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  28 
 
 
209 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5530  lipase/acylhydrolase, putative  23.66 
 
 
269 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  35.48 
 
 
343 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  25.36 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  25.4 
 
 
185 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1589  lipolytic protein G-D-S-L family  24.44 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0691726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  25.95 
 
 
189 aa  45.4  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  30.57 
 
 
218 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5099  lipase/acylhydrolase  23.83 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5253  lipase/acylhydrolase  23.83 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5651  lipase/acylhydrolase  23.83 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  25.52 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  24.87 
 
 
190 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  25.52 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>