More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4335 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  66.79 
 
 		 518 aa  701    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  62.28 
 
 		 515 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  62.48 
 
 		 511 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  64.92 
 
 		 508 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 521 aa  1066    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  61.04 
 
 		 511 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  60.65 
 
 		 519 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  54.58 
 
 		 527 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  56.73 
 
 		 522 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.58 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  53.67 
 
 		 521 aa  521  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  53.46 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  45.77 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  48.55 
 
 		 506 aa  455  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  49.42 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  48.55 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  45.8 
 
 		 506 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  48.56 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  48.17 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  46.71 
 
 		 499 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.28 
 
 		 500 aa  412  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.26 
 
 		 514 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  45.27 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  44.32 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  43.89 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.84 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  43.13 
 
 		 508 aa  372  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.58 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.58 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.58 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.58 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.58 
 
 		 510 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0411  AMP-dependent synthetase and ligase  45.11 
 
 		 513 aa  357  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 		 492 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.88 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 539 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 490 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  41.6 
 
 		 510 aa  342  9e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.3 
 
 		 561 aa  339  8e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 583 aa  339  9e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 559 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 		 582 aa  336  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 536 aa  335  7.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 527 aa  335  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 		 662 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 		 561 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 		 561 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 		 561 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 573 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 498 aa  333  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 564 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 585 aa  332  9e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 582 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 551 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 563 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 563 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.3 
 
 		 585 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 		 502 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 566 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 557 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 549 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 583 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 		 577 aa  320  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 569 aa  319  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 520 aa  312  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 520 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 543 aa  309  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.18 
 
 		 577 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2902  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 523 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475075  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.84 
 
 		 560 aa  300  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 554 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 506 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 559 aa  299  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.68 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 559 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 566 aa  297  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 559 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 544 aa  297  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>