More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0663 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  100 
 
 
351 aa  701    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  57.79 
 
 
321 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  59.54 
 
 
319 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  55.21 
 
 
335 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  55.96 
 
 
336 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  56.09 
 
 
321 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  57.49 
 
 
317 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  57.49 
 
 
317 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  57.49 
 
 
317 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  53.01 
 
 
351 aa  345  7e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  53.04 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  54.17 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  50.56 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  53.56 
 
 
381 aa  312  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  49.72 
 
 
335 aa  296  4e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  46.58 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  46.8 
 
 
348 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  48.73 
 
 
332 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  44.48 
 
 
324 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  42.42 
 
 
363 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  45.51 
 
 
322 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  45.86 
 
 
336 aa  246  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  44.98 
 
 
332 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  44.98 
 
 
315 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  44.71 
 
 
313 aa  225  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  41.81 
 
 
319 aa  212  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  43.07 
 
 
301 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  38.63 
 
 
307 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  41.49 
 
 
301 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  40.32 
 
 
338 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 
307 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  37.91 
 
 
307 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  38.27 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  40.96 
 
 
297 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 
307 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 
307 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  40.66 
 
 
294 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 
308 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  38.62 
 
 
313 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  39.6 
 
 
307 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  39.46 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  41.11 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  39.64 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  37.24 
 
 
307 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  40.54 
 
 
304 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  37.24 
 
 
307 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  37.8 
 
 
307 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  39.25 
 
 
306 aa  175  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  40.55 
 
 
309 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  37.55 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  38.95 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  38.6 
 
 
305 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  38.52 
 
 
305 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  36.88 
 
 
311 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  39.78 
 
 
294 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  37.18 
 
 
306 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  36.52 
 
 
310 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  40.51 
 
 
293 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  37.89 
 
 
305 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  40.15 
 
 
293 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  40.15 
 
 
293 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  39.42 
 
 
294 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 
312 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  37.64 
 
 
312 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  36.11 
 
 
311 aa  169  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  36.8 
 
 
313 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  39.42 
 
 
294 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  38.11 
 
 
312 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  36.67 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  41.47 
 
 
291 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  37.72 
 
 
314 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  37.09 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  37.11 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  38.52 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  40.54 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  39.42 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  36.67 
 
 
305 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  40.7 
 
 
293 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  38.38 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  40.31 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  34.01 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  40.31 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  36.3 
 
 
306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  39.22 
 
 
301 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  37.28 
 
 
294 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  40.7 
 
 
293 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  39.22 
 
 
307 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.86 
 
 
296 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  39.13 
 
 
307 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  39.22 
 
 
301 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  39.53 
 
 
293 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  34.6 
 
 
293 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.26 
 
 
291 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  37.59 
 
 
340 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  37.63 
 
 
296 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  39.76 
 
 
291 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  38.52 
 
 
307 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  39.53 
 
 
293 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  39.53 
 
 
293 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  34.31 
 
 
290 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>