More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0017 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  70.91 
 
 
181 aa  229  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  75.74 
 
 
182 aa  229  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  68.45 
 
 
177 aa  228  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  70.3 
 
 
187 aa  226  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  70.41 
 
 
182 aa  219  1e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.57 
 
 
179 aa  217  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  68.18 
 
 
177 aa  216  9e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  70.59 
 
 
178 aa  214  6e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  70.91 
 
 
175 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  69.41 
 
 
182 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  70.91 
 
 
175 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  63.58 
 
 
173 aa  209  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  70.91 
 
 
175 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  70.91 
 
 
173 aa  208  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  68.24 
 
 
182 aa  207  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  62.57 
 
 
175 aa  204  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  68 
 
 
179 aa  202  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  62.05 
 
 
176 aa  201  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  60.57 
 
 
179 aa  200  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  60.82 
 
 
175 aa  199  1e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  61.18 
 
 
174 aa  198  2e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  63.01 
 
 
178 aa  198  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  61.68 
 
 
174 aa  195  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  58.29 
 
 
181 aa  194  4e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  65.29 
 
 
176 aa  194  5e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  62.8 
 
 
206 aa  192  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  65.48 
 
 
176 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  57.71 
 
 
181 aa  191  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.77678e-13 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  60.11 
 
 
193 aa  190  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  57.14 
 
 
178 aa  188  3e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  62.87 
 
 
170 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.12 
 
 
172 aa  182  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  62.86 
 
 
179 aa  181  5e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  62.35 
 
 
177 aa  177  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  56.89 
 
 
188 aa  174  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  56.65 
 
 
176 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  55.62 
 
 
188 aa  171  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  58.29 
 
 
189 aa  171  6e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  59.89 
 
 
184 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  56.63 
 
 
310 aa  166  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  52.05 
 
 
172 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  50.87 
 
 
172 aa  165  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  59.3 
 
 
176 aa  161  4e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.42 
 
 
310 aa  160  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  59.64 
 
 
180 aa  160  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  50.87 
 
 
176 aa  158  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.3 
 
 
378 aa  157  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  51.18 
 
 
287 aa  156  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  50.59 
 
 
241 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.02 
 
 
201 aa  150  6e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  58.54 
 
 
228 aa  150  9e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.18 
 
 
310 aa  150  9e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  55.24 
 
 
357 aa  146  2e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.09 
 
 
376 aa  145  2e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  55.86 
 
 
372 aa  145  2e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  48.19 
 
 
657 aa  145  4e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  58.04 
 
 
164 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  58.04 
 
 
164 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
266 aa  139  2e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  55.86 
 
 
197 aa  135  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  3.17427e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  46.58 
 
 
571 aa  135  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  45.18 
 
 
629 aa  135  3e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.85 
 
 
164 aa  135  3e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.42 
 
 
322 aa  135  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  61.48 
 
 
168 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  53.8 
 
 
168 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  53.22 
 
 
168 aa  134  6e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  60.74 
 
 
168 aa  134  6e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.46 
 
 
466 aa  134  7e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.68 
 
 
468 aa  134  7e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  46.39 
 
 
665 aa  133  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  49.15 
 
 
179 aa  132  2e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  54.62 
 
 
376 aa  132  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.34 
 
 
202 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  51.53 
 
 
167 aa  130  7e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  48.39 
 
 
254 aa  130  1e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  48.17 
 
 
222 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  55.88 
 
 
223 aa  127  7e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  52.82 
 
 
163 aa  127  7e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.78 
 
 
218 aa  127  7e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  46.06 
 
 
156 aa  126  1e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  48.48 
 
 
629 aa  125  4e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.68 
 
 
230 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.68 
 
 
230 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.45 
 
 
196 aa  124  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  52.17 
 
 
147 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  45.3 
 
 
181 aa  123  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  45.73 
 
 
155 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  39.8 
 
 
197 aa  122  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  44.85 
 
 
172 aa  121  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  44.1 
 
 
174 aa  120  7e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  52.05 
 
 
197 aa  120  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
254 aa  119  1e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  5.98862e-05 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  53.85 
 
 
167 aa  120  1e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  39.29 
 
 
197 aa  119  2e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  45.61 
 
 
181 aa  119  2e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0973  peptidylprolyl isomerase  39.29 
 
 
197 aa  119  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0954  peptidylprolyl isomerase  39.29 
 
 
197 aa  119  2e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1460  peptidylprolyl isomerase  48.65 
 
 
166 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>