More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2660 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  100 
 
 
115 aa  236  7e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  52.73 
 
 
121 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  54.81 
 
 
158 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  51.72 
 
 
123 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  52.88 
 
 
116 aa  122  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  5.27491e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  54.13 
 
 
114 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.74363e-11  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  54.81 
 
 
130 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  53.33 
 
 
118 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  53.33 
 
 
118 aa  120  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  50.48 
 
 
122 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  53.33 
 
 
109 aa  119  1e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  8.6194e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  53.33 
 
 
109 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.43508e-10  hitchhiker  4.78913e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  53.33 
 
 
109 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.12761e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  50.88 
 
 
117 aa  117  4e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  55.66 
 
 
173 aa  117  5e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  53.4 
 
 
114 aa  116  1e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.16802e-08  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  53.4 
 
 
114 aa  116  1e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.32969e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  60.58 
 
 
125 aa  115  2e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  52 
 
 
119 aa  114  4e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  48.62 
 
 
115 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  49.52 
 
 
109 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  48.08 
 
 
123 aa  113  7e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  48.08 
 
 
128 aa  113  1e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  51.43 
 
 
117 aa  112  1e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  52.38 
 
 
137 aa  112  1e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  49.07 
 
 
108 aa  112  1e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.97602e-10  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  49.06 
 
 
116 aa  112  2e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  2.52813e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  52.38 
 
 
203 aa  112  2e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  49.06 
 
 
116 aa  112  2e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  50.48 
 
 
109 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.12346e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  53.19 
 
 
148 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  49.51 
 
 
114 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29081e-07  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  49.51 
 
 
114 aa  111  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  9.71305e-10  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  49.51 
 
 
114 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.84153e-09  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  48.57 
 
 
109 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.80611e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  52.38 
 
 
205 aa  111  4e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  52.38 
 
 
213 aa  111  4e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  52.13 
 
 
148 aa  109  1e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  50 
 
 
149 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  47.12 
 
 
106 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  48.08 
 
 
154 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  49.04 
 
 
147 aa  107  7e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  49.04 
 
 
147 aa  107  7e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  48.08 
 
 
146 aa  107  7e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  48.08 
 
 
146 aa  107  7e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  48 
 
 
140 aa  107  7e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  49.04 
 
 
148 aa  107  7e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  49.04 
 
 
147 aa  107  7e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  44.76 
 
 
105 aa  106  8e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  47.62 
 
 
109 aa  106  8e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.76434e-08  unclonable  3.77675e-11 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  48.08 
 
 
152 aa  106  9e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  48.08 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  48.08 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  48.08 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  50.96 
 
 
241 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  48.08 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  47 
 
 
105 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  48.51 
 
 
139 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  49 
 
 
158 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  48.51 
 
 
139 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  48.08 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  48.08 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  48.08 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.19857e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.22967e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.77395e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.27237e-08  normal  0.102561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  6.79952e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12038e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.84258e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  47.12 
 
 
154 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.07419e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.95107e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  46 
 
 
289 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  50 
 
 
256 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.76829e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  47.12 
 
 
151 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  45.71 
 
 
109 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.19797e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  46.53 
 
 
274 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  47.62 
 
 
115 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.5875e-09  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  46 
 
 
105 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  46 
 
 
105 aa  104  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  45.05 
 
 
120 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  46 
 
 
105 aa  104  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.13985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  47 
 
 
105 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  48.08 
 
 
109 aa  103  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.43073e-09  decreased coverage  2.04323e-07 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  46 
 
 
164 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  47.52 
 
 
142 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  45.54 
 
 
263 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  44.33 
 
 
112 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  45 
 
 
105 aa  102  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  44.33 
 
 
112 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  45.1 
 
 
221 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  44.14 
 
 
164 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  45.45 
 
 
105 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  46 
 
 
105 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>