More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1844 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  65.75 
 
 		 476 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  89.96 
 
 		 478 aa  872    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  66.6 
 
 		 476 aa  646    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  68.15 
 
 		 477 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  70.29 
 
 		 482 aa  699    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  100 
 
 		 478 aa  966    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  67.09 
 
 		 477 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  68.15 
 
 		 477 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  66.17 
 
 		 476 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  65.26 
 
 		 477 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  64.21 
 
 		 477 aa  620  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  63.39 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  64.06 
 
 		 477 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  62.29 
 
 		 480 aa  610  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  62.97 
 
 		 481 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  63.39 
 
 		 481 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  63.39 
 
 		 481 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  64.06 
 
 		 477 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  61.84 
 
 		 482 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  65.2 
 
 		 477 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  63.26 
 
 		 479 aa  594  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  63.81 
 
 		 481 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  63.6 
 
 		 481 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  63.6 
 
 		 481 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  61.1 
 
 		 481 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  63.18 
 
 		 481 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  62.05 
 
 		 481 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  61.84 
 
 		 481 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  59.37 
 
 		 479 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  62.61 
 
 		 480 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.12 
 
 		 475 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  61.31 
 
 		 480 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  61.92 
 
 		 478 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  61.09 
 
 		 478 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  62.13 
 
 		 478 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.75 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  56.42 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  55.6 
 
 		 477 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  54.97 
 
 		 476 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  52.31 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.38 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.06 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  52.42 
 
 		 478 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 485 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 495 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 		 487 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  51.89 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  51.89 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 		 478 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 496 aa  468  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  52.88 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.94 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  46.35 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  47.08 
 
 		 493 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  45.97 
 
 		 478 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3766  aldehyde dehydrogenase  44.51 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 		 493 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.47 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.06 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  43.48 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.06 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.82 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  44.09 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.71 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.76 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.38 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.05 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.14 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.86 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.03 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.5 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.84 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.05 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.05 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.84 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.97 
 
 		 487 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.38 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.05 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.09 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.42 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.84 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.43 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.09 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.36 
 
 		 483 aa  372  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.42 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.86 
 
 		 483 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.42 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.54 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  41.15 
 
 		 483 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.03 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.27 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.09 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.7 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.97 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>