More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1709 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  71.67 
 
 		 474 aa  693    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  67.52 
 
 		 473 aa  651    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  67.94 
 
 		 473 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  70.7 
 
 		 474 aa  676    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  89.94 
 
 		 496 aa  877    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  72.3 
 
 		 474 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  69.13 
 
 		 473 aa  657    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  69.64 
 
 		 474 aa  663    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  80.55 
 
 		 474 aa  789    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 473 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  82.24 
 
 		 473 aa  782    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  78.65 
 
 		 474 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  82.45 
 
 		 473 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 491 aa  1001    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  81.82 
 
 		 473 aa  798    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 471 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  70.8 
 
 		 475 aa  677    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  71.55 
 
 		 474 aa  695    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  69.34 
 
 		 473 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  69.64 
 
 		 474 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 475 aa  627  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 476 aa  621  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 		 490 aa  611  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 487 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  55.65 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 471 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 465 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 466 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 465 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 466 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 466 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 475 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 459 aa  402  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 475 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 509 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 467 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 470 aa  392  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  43.01 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 467 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>