More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0102 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  90.78 
 
 		 293 aa  530  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  83.96 
 
 		 293 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  82.09 
 
 		 296 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  82.77 
 
 		 296 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  79.05 
 
 		 296 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  77.03 
 
 		 298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  58.05 
 
 		 297 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  58.13 
 
 		 294 aa  318  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  55.52 
 
 		 293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  54.48 
 
 		 293 aa  305  7e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  54.48 
 
 		 293 aa  305  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  54.76 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  56.08 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  54.11 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  55.21 
 
 		 288 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  51.86 
 
 		 296 aa  289  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  49.01 
 
 		 303 aa  287  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  51.18 
 
 		 292 aa  281  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  53.62 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  51.84 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  51.37 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  50 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  47.12 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  46.42 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  48.79 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  48.84 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  53.02 
 
 		 300 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  53.02 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  48.26 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  48.26 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  46.42 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  52.35 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  49.62 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  45.36 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  46.53 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  45.04 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  46.6 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  45.87 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  48.65 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  42.81 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  39.44 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.69 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.06 
 
 		 283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  44.48 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.27 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  42.19 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  44.79 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  43.06 
 
 		 290 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.31 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  44.41 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  44.41 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  43.45 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  43.64 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  42.95 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  42.33 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  42.76 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  41.87 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.61 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  43.85 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  41.26 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  39.3 
 
 		 272 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  41.81 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  40.8 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  40.8 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  41.87 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  41.29 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  43.05 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  40.21 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  42.97 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40.48 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  44.29 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  43.21 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  38.98 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  39.38 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  43.21 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40.8 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  42.51 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.55 
 
 		 284 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  38.7 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  39.71 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  40.88 
 
 		 309 aa  191  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  40.91 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  40.91 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  44.39 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  39.93 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  42.81 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  40.21 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  40.61 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  37.36 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  38.83 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  39.86 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  38.83 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>