218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0037 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01465  Catalase  57.63 
 
 
781 aa  806  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1363  catalase/peroxidase HPI  68.81 
 
 
757 aa  1003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5625  catalase/peroxidase HPI  61.84 
 
 
741 aa  840  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482578  normal  0.0776972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0642  catalase/peroxidase HPI  73.62 
 
 
728 aa  1071  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0281  catalase/peroxidase HPI  56.39 
 
 
723 aa  818  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5078  catalase/peroxidase HPI  70.5 
 
 
728 aa  1007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1432  catalase  68.5 
 
 
757 aa  1001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0694  catalase/peroxidase HPI  75 
 
 
728 aa  1088  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.48718  normal  0.187409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3905  catalase/peroxidase HPI  59.57 
 
 
736 aa  848  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.211308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4830  catalase/peroxidase HPI  51.8 
 
 
772 aa  760  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2235  catalase/peroxidase HPI  67.02 
 
 
752 aa  989  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4390  catalase/peroxidase HPI  60.96 
 
 
726 aa  855  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.75327  normal  0.428476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0973  catalase/peroxidase HPI  71.31 
 
 
738 aa  1058  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.281287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4429  catalase/peroxidase HPI  60.96 
 
 
726 aa  855  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4324  catalase/peroxidase HPI  61.72 
 
 
726 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4441  catalase/peroxidase HPI  61.5 
 
 
726 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0233722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4438  catalase/peroxidase HPI  61.5 
 
 
726 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.274968  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0100  catalase/peroxidase HPI  67.26 
 
 
732 aa  953  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0148  catalase/peroxidase HPI  68.13 
 
 
732 aa  984  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0029119  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0433  catalase/peroxidase HPI  78.6 
 
 
736 aa  1157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0152  catalase/peroxidase HPI  68.27 
 
 
732 aa  980  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00125055  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1795  catalase/peroxidase HPI  67.3 
 
 
735 aa  988  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0134  catalase/peroxidase HPI  68.54 
 
 
732 aa  974  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  8.54212e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2922  catalase/peroxidase HPI  65.52 
 
 
721 aa  910  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2078  catalase/peroxidase HPI  70.04 
 
 
753 aa  1015  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.582232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4073  catalase/peroxidase HPI  60.96 
 
 
726 aa  855  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3388  catalase/peroxidase HPI  60.03 
 
 
737 aa  867  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1508  catalase/peroxidase HPI  58.29 
 
 
721 aa  832  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.889883  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0959  catalase/peroxidase HPI  72.97 
 
 
733 aa  1088  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209132  normal  0.954436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3254  catalase/peroxidase HPI  60.17 
 
 
737 aa  868  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3489  catalase/peroxidase HPI  69.79 
 
 
723 aa  1026  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.50294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1585  catalase/peroxidase HPI  67.84 
 
 
737 aa  1035  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  77.26 
 
 
729 aa  1121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11937  catalase-peroxidase katG  62.7 
 
 
740 aa  894  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  65.96 
 
 
751 aa  973  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  74.72 
 
 
726 aa  1071  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  71.82 
 
 
728 aa  1040  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1166  catalase/peroxidase  59.13 
 
 
724 aa  859  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.801479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01773  catylase/peroxidase  58.24 
 
 
726 aa  856  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4176  catalase/peroxidase HPI  60.96 
 
 
726 aa  855  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1076  catalase/peroxidase HPI  68.11 
 
 
737 aa  963  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257821  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2231  catalase/peroxidase HPI  66.49 
 
 
751 aa  976  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.659262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0916  catalase-peroxidase  60.17 
 
 
737 aa  868  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.628079  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2660  catalase/peroxidase HPI  73.34 
 
 
736 aa  1073  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0755536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3612  catalase/peroxidase HPI  69.89 
 
 
721 aa  1024  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0699012  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3801  catalase/peroxidase HPI  53.78 
 
 
725 aa  734  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.295897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2160  catalase/peroxidase HPI  68.94 
 
 
758 aa  963  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1646  catalase/peroxidase HPI  70.37 
 
 
732 aa  1014  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1533  catalase/peroxidase HPI  67.57 
 
 
743 aa  999  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3192  catalase/peroxidase HPI  72.02 
 
 
732 aa  1030  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4482  catalase/peroxidase HPI  60.96 
 
 
726 aa  856  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.789158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  67.33 
 
 
757 aa  1021  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10808  catalase/peroxidase  60.49 
 
 
740 aa  882  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.661719  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2177  catalase/peroxidase HPI  65.29 
 
 
730 aa  946  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2689  catalase/peroxidase HPI  58.17 
 
 
724 aa  822  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2535  catalase/peroxidase HPI  66.94 
 
 
736 aa  959  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3813  catalase/peroxidase HPI  64.71 
 
 
741 aa  917  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00829986  normal  0.21401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0871  catalase/peroxidase HPI  69.28 
 
 
731 aa  1060  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0581387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0741  catalase/peroxidase HPI  59.52 
 
 
733 aa  806  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.038658  normal  0.22013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1069  catalase/peroxidase HPI  68.67 
 
 
735 aa  1007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2757  catalase/peroxidase HPI  60.14 
 
 
711 aa  836  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5378  catalase/peroxidase HPI  66.93 
 
 
756 aa  960  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4453  catalase/peroxidase HPI  65.24 
 
 
745 aa  936  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.958219 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0295  catalase/peroxidase HPI  58.31 
 
 
729 aa  852  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2715  catalase/peroxidase HPI  61.2 
 
 
739 aa  890  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.137807  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000266  catalase/peroxidase  58.24 
 
 
723 aa  840  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2267  catalase/peroxidase HPI  60.63 
 
 
736 aa  870  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.826478  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1663  catalase/peroxidase HPI  66.44 
 
 
793 aa  988  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1880  catalase/peroxidase HPI  66.71 
 
 
741 aa  971  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500233  normal  0.0120465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3120  catalase/peroxidase HPI  60.8 
 
 
727 aa  873  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.750277  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2075  catalase/peroxidase HPI  56.17 
 
 
726 aa  824  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12147  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2666  catalase/peroxidase HPI  58.3 
 
 
722 aa  820  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0927  catalase/peroxidase HPI  60.08 
 
 
728 aa  860  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2724  catalase/peroxidase HPI  63.67 
 
 
742 aa  920  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217808  normal  0.700695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5085  catalase/peroxidase HPI  68.35 
 
 
749 aa  1035  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.060305  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3312  catalase/peroxidase HPI  58.67 
 
 
730 aa  818  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1936  catalase/peroxidase HPI  69.68 
 
 
747 aa  1036  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0354828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4193  catalase/peroxidase HPI  66.67 
 
 
742 aa  993  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1517  catalase/peroxidase HPI  67.85 
 
 
757 aa  998  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3365  catalase/peroxidase HPI  66.99 
 
 
768 aa  951  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2625  catalase/peroxidase HPI  75.88 
 
 
712 aa  1045  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.030507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2096  catalase/peroxidase HPI  69.97 
 
 
730 aa  1061  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00122798  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18572  catalase-peroxidase  55.69 
 
 
736 aa  833  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2655  catalase/peroxidase HPI  68.86 
 
 
733 aa  958  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3414  catalase/peroxidase HPI  69.61 
 
 
721 aa  1019  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0063  catalase/peroxidase HPI  59.46 
 
 
724 aa  833  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4680  catalase/peroxidase HPI  77.18 
 
 
727 aa  1094  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.56744  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5403  catalase/peroxidase HPI  60.96 
 
 
726 aa  856  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0099  catalase/peroxidase HPI  59.8 
 
 
736 aa  865  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.311773  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4512  catalase/peroxidase HPI  61.5 
 
 
726 aa  867  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0570148 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8179  catalase/peroxidase HPI  79.81 
 
 
745 aa  1179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1107  hypothetical protein  58.17 
 
 
723 aa  852  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0619  catalase/peroxidase HPI  68.77 
 
 
756 aa  1001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458346  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0311  catalase/peroxidase HPI  69.42 
 
 
733 aa  1019  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2402  catalase/peroxidase HPI  58.04 
 
 
724 aa  826  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2763  catalase/peroxidase HPI  74.59 
 
 
732 aa  1075  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03777  hypothetical protein  61.1 
 
 
726 aa  857  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1362  catalase/peroxidase HPI  73.18 
 
 
728 aa  1051  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2510  catalase/peroxidase HPI  64.88 
 
 
721 aa  905  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4726  catalase/peroxidase HPI  77.6 
 
 
729 aa  1107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>