218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0223 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07388  Catalase-peroxidase (CP)(EC 1.11.1.6)(EC 1.11.1.7)(Peroxidase/catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96VT4]  66.07 
 
 		 739 aa  944    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11937  catalase-peroxidase katG  65.01 
 
 		 740 aa  900    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  75.14 
 
 		 726 aa  1078    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03828  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  61.71 
 
 		 726 aa  859    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4043  catalase/peroxidase HPI  61.57 
 
 		 726 aa  858    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2100  catalase/peroxidase  69.38 
 
 		 727 aa  967    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3668  catalase/peroxidase HPI  65.6 
 
 		 751 aa  944    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0509082  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0775  peroxidase/catalase oxidoreductase protein  73.8 
 
 		 455 aa  675    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.392915  decreased coverage  0.00378616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10808  catalase/peroxidase  61.13 
 
 		 740 aa  877    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.661719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1344  catalase/peroxidase HPI  60.03 
 
 		 740 aa  867    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0725  catalase/peroxidase HPI  61.92 
 
 		 741 aa  859    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4405  catalase/peroxidase HPI  61.41 
 
 		 728 aa  877    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4530  catalase/peroxidase HPI  68.13 
 
 		 756 aa  1007    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2391  catalase/peroxidase HPI  74.9 
 
 		 728 aa  1103    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.347658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  63.89 
 
 		 749 aa  948    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2454  catalase-peroxidase KatB  58.7 
 
 		 721 aa  839    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  63.06 
 
 		 749 aa  947    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2313  catalase-peroxidase KatB  58.56 
 
 		 721 aa  845    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  71.9 
 
 		 728 aa  1029    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3881  catalase/peroxidase HPI  65.19 
 
 		 716 aa  895    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4208  haem catalase/peroxidase  69.06 
 
 		 756 aa  1018    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3836  heme catalase/peroxidase  68.26 
 
 		 736 aa  926    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1635  heme catalase/peroxidase  65.25 
 
 		 751 aa  930    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1741  heme catalase/peroxidase  72.04 
 
 		 728 aa  1029    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0030  haem catalase/peroxidase  77.87 
 
 		 729 aa  1140    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.187858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3366  catalase/peroxidase HPI  74.9 
 
 		 728 aa  1105    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2201  haem catalase/peroxidase  66.84 
 
 		 755 aa  987    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1175  catalase/peroxidase HPI  68.18 
 
 		 739 aa  985    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3814  haem catalase/peroxidase  73.83 
 
 		 728 aa  1070    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0386  haem catalase/peroxidase  70.33 
 
 		 733 aa  1055    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0181  catalase/peroxidase HPI  60.8 
 
 		 729 aa  823    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.877422  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1656  catalase/peroxidase HPI  59.67 
 
 		 720 aa  860    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1282  catalase/peroxidase HPI  74.62 
 
 		 728 aa  1108    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1918  catalase/peroxidase HPI  66.85 
 
 		 744 aa  988    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108605  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0610  catalase/peroxidase HPI  92.5 
 
 		 732 aa  1341    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2909  catalase/peroxidase HPI  64.15 
 
 		 747 aa  874    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2433  catalase/peroxidase HPI  71.73 
 
 		 718 aa  1025    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1586  catalase/peroxidase HPI  59.68 
 
 		 735 aa  879    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.711142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3888  catalase  61.16 
 
 		 738 aa  893    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.691403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0361  catalase/peroxidase HPI  79.67 
 
 		 732 aa  1173    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0678  catalase/peroxidase HPI  73.53 
 
 		 731 aa  1078    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627364  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0772  haem catalase/peroxidase  69.64 
 
 		 753 aa  1009    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1384  catalase/peroxidase HPI  55.95 
 
 		 720 aa  801    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0223  catalase/peroxidase HPI  100 
 
 		 732 aa  1493    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0159  catalase/peroxidase HPI  56.3 
 
 		 717 aa  790    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0037  catalase/peroxidase HPI  77.67 
 
 		 729 aa  1129    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5371  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  71.51 
 
 		 726 aa  1007    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1356  catalase/peroxidase HPI  69.41 
 
 		 752 aa  1002    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2791  catalase/peroxidase HPI  64.5 
 
 		 738 aa  956    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2146  catalase/peroxidase HPI  58.49 
 
 		 731 aa  808    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0242  catalase/peroxidase HPI  73.42 
 
 		 728 aa  1066    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3169  catalase/peroxidase HPI  71.51 
 
 		 728 aa  1008    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2682  catalase/peroxidase HPI  64.14 
 
 		 749 aa  918    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1975  catalase/peroxidase HPI  58.82 
 
 		 753 aa  832    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0626  catalase/peroxidase HPI  82.6 
 
 		 726 aa  1186    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  80.57 
 
 		 729 aa  1178    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4032  catalase/peroxidase HPI  61.38 
 
 		 726 aa  867    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  68.12 
 
 		 757 aa  1019    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0311  catalase/peroxidase HPI  61.01 
 
 		 728 aa  895    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3379  catalase/peroxidase HPI  62.57 
 
 		 739 aa  890    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0574  catalase/peroxidase HPI  63.14 
 
 		 739 aa  899    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3713  catalase/peroxidase HPI  61.01 
 
 		 728 aa  877    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1522  catalase/peroxidase HPI  58.8 
 
 		 723 aa  838    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329951  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1917  catalase/peroxidase HPI  59.53 
 
 		 738 aa  852    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.151995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3122  catalase/peroxidase HPI  57.75 
 
 		 757 aa  817    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2686  catalase/peroxidase HPI  57.37 
 
 		 724 aa  807    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0616  catalase/peroxidase HPI  72.63 
 
 		 728 aa  1055    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.246482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5842  catalase/peroxidase HPI  61.9 
 
 		 741 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0726  catalase/peroxidase HPI  73.42 
 
 		 728 aa  1066    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5199  catalase/peroxidase HPI  71.51 
 
 		 728 aa  1008    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0306  catalase/peroxidase HPI  61.01 
 
 		 728 aa  858    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3549  catalase/peroxidase HPI  63.14 
 
 		 739 aa  905    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1387  catalase/peroxidase HPI  67.8 
 
 		 736 aa  967    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0755  catalase/peroxidase HPI  67.99 
 
 		 732 aa  951    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0577026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2497  catalase/peroxidase HPI  58.78 
 
 		 725 aa  820    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0875  catalase/peroxidase HPI  66.44 
 
 		 760 aa  934    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0745  catalase  62.43 
 
 		 738 aa  905    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3270  catalase  57.55 
 
 		 718 aa  810    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2727  catalase/peroxidase HPI  64.14 
 
 		 749 aa  918    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2142  catalase/peroxidase HPI  57.45 
 
 		 724 aa  840    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.501664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2984  catalase/peroxidase HPI  56.39 
 
 		 737 aa  814    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156049  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3208  catalase/peroxidase HPI  63.71 
 
 		 747 aa  912    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1056  catalase/peroxidase HPI  56.81 
 
 		 723 aa  811    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3132  catalase/peroxidase HPI  68.24 
 
 		 743 aa  984    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0936782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0308  catalase/peroxidase HPI  74.9 
 
 		 728 aa  1103    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0547  catalase/peroxidase HPI  57.49 
 
 		 724 aa  820    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.474968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3740  catalase  67.31 
 
 		 715 aa  932    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1169  catalase/peroxidase HPI  74.9 
 
 		 728 aa  1103    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  65.47 
 
 		 751 aa  944    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0415  catalase/peroxidase HPI  60.79 
 
 		 728 aa  889    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0875  catalase/peroxidase HPI  69.57 
 
 		 721 aa  1006    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3322  catalase/peroxidase HPI  74.9 
 
 		 728 aa  1103    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3356  catalase/peroxidase HPI  74.9 
 
 		 728 aa  1103    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0335715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2713  catalase/peroxidase HPI  64.14 
 
 		 749 aa  918    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2578  catalase/peroxidase HPI  74.9 
 
 		 728 aa  1103    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0709  catalase/peroxidase HPI  58.83 
 
 		 756 aa  811    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3451  catalase/peroxidase HPI  64.04 
 
 		 748 aa  921    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3306  hypothetical protein  59.13 
 
 		 724 aa  838    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.706262  normal  0.467266 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1166  catalase/peroxidase  59.68 
 
 		 724 aa  858    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.801479  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2044  catalase/peroxidase HPI  55.77 
 
 		 717 aa  804    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.73931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>