217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3379 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07388  Catalase-peroxidase (CP)(EC 1.11.1.6)(EC 1.11.1.7)(Peroxidase/catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96VT4]  59.46 
 
 		 739 aa  843    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  62.2 
 
 		 729 aa  908    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  63.71 
 
 		 728 aa  904    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03828  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  55.92 
 
 		 726 aa  771    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4043  catalase/peroxidase HPI  55.77 
 
 		 726 aa  769    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2100  catalase/peroxidase  62.25 
 
 		 727 aa  887    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3668  catalase/peroxidase HPI  61.54 
 
 		 751 aa  891    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0509082  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10808  catalase/peroxidase  59.58 
 
 		 740 aa  880    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.661719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1585  catalase/peroxidase HPI  65.21 
 
 		 737 aa  967    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1344  catalase/peroxidase HPI  65.68 
 
 		 740 aa  1030    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0725  catalase/peroxidase HPI  93.25 
 
 		 741 aa  1382    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4405  catalase/peroxidase HPI  56.08 
 
 		 728 aa  796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4530  catalase/peroxidase HPI  60.41 
 
 		 756 aa  905    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2391  catalase/peroxidase HPI  62.38 
 
 		 728 aa  927    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.347658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  65.05 
 
 		 749 aa  1021    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2454  catalase-peroxidase KatB  56.32 
 
 		 721 aa  792    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  65.45 
 
 		 749 aa  1028    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2313  catalase-peroxidase KatB  56.18 
 
 		 721 aa  790    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1166  catalase/peroxidase  57.78 
 
 		 724 aa  813    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.801479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  61.27 
 
 		 751 aa  890    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4208  haem catalase/peroxidase  60.54 
 
 		 756 aa  913    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3836  heme catalase/peroxidase  62.97 
 
 		 736 aa  837    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1635  heme catalase/peroxidase  61.95 
 
 		 751 aa  887    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1741  heme catalase/peroxidase  62.62 
 
 		 728 aa  887    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0030  haem catalase/peroxidase  63.84 
 
 		 729 aa  902    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.187858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3366  catalase/peroxidase HPI  62.38 
 
 		 728 aa  928    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2201  haem catalase/peroxidase  60.38 
 
 		 755 aa  904    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1175  catalase/peroxidase HPI  62.1 
 
 		 739 aa  914    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3814  haem catalase/peroxidase  63.36 
 
 		 728 aa  927    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0386  haem catalase/peroxidase  63.53 
 
 		 733 aa  938    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0181  catalase/peroxidase HPI  56.82 
 
 		 729 aa  805    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.877422  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1656  catalase/peroxidase HPI  55.77 
 
 		 720 aa  795    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1282  catalase/peroxidase HPI  62.38 
 
 		 728 aa  931    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1918  catalase/peroxidase HPI  61.02 
 
 		 744 aa  923    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108605  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0610  catalase/peroxidase HPI  62.57 
 
 		 732 aa  877    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2909  catalase/peroxidase HPI  71.21 
 
 		 747 aa  1008    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2433  catalase/peroxidase HPI  63.22 
 
 		 718 aa  927    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1586  catalase/peroxidase HPI  56.98 
 
 		 735 aa  828    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.711142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3888  catalase  61.14 
 
 		 738 aa  959    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.691403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0361  catalase/peroxidase HPI  65.21 
 
 		 732 aa  924    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0678  catalase/peroxidase HPI  65.68 
 
 		 731 aa  957    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627364  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0772  haem catalase/peroxidase  61.49 
 
 		 753 aa  891    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1384  catalase/peroxidase HPI  51.8 
 
 		 720 aa  748    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0223  catalase/peroxidase HPI  62.57 
 
 		 732 aa  872    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0159  catalase/peroxidase HPI  53.71 
 
 		 717 aa  755    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0037  catalase/peroxidase HPI  61.99 
 
 		 729 aa  891    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5371  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  62.23 
 
 		 726 aa  869    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1356  catalase/peroxidase HPI  64.12 
 
 		 752 aa  932    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2791  catalase/peroxidase HPI  60.59 
 
 		 738 aa  875    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2146  catalase/peroxidase HPI  56.55 
 
 		 731 aa  756    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0242  catalase/peroxidase HPI  63.78 
 
 		 728 aa  928    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3169  catalase/peroxidase HPI  63.01 
 
 		 728 aa  876    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2682  catalase/peroxidase HPI  60.25 
 
 		 749 aa  876    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1975  catalase/peroxidase HPI  64.46 
 
 		 753 aa  985    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0626  catalase/peroxidase HPI  63.92 
 
 		 726 aa  919    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11937  catalase-peroxidase katG  58.96 
 
 		 740 aa  813    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3881  catalase/peroxidase HPI  60.17 
 
 		 716 aa  818    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0311  catalase/peroxidase HPI  56.5 
 
 		 728 aa  816    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3379  catalase/peroxidase HPI  100 
 
 		 739 aa  1521    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0574  catalase/peroxidase HPI  98.24 
 
 		 739 aa  1498    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3713  catalase/peroxidase HPI  56.5 
 
 		 728 aa  808    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1522  catalase/peroxidase HPI  55.32 
 
 		 723 aa  790    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329951  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1917  catalase/peroxidase HPI  57.44 
 
 		 738 aa  798    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.151995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3122  catalase/peroxidase HPI  66.06 
 
 		 757 aa  966    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2686  catalase/peroxidase HPI  54.65 
 
 		 724 aa  755    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0616  catalase/peroxidase HPI  63.78 
 
 		 728 aa  924    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.246482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5842  catalase/peroxidase HPI  67.21 
 
 		 741 aa  987    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0726  catalase/peroxidase HPI  63.78 
 
 		 728 aa  928    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5199  catalase/peroxidase HPI  63.01 
 
 		 728 aa  876    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0306  catalase/peroxidase HPI  56.08 
 
 		 728 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3549  catalase/peroxidase HPI  96.75 
 
 		 739 aa  1450    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1387  catalase/peroxidase HPI  61.57 
 
 		 736 aa  885    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0755  catalase/peroxidase HPI  60.88 
 
 		 732 aa  864    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0577026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2497  catalase/peroxidase HPI  55.63 
 
 		 725 aa  777    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0875  catalase/peroxidase HPI  60.23 
 
 		 760 aa  848    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0745  catalase  79.51 
 
 		 738 aa  1247    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3270  catalase  55.25 
 
 		 718 aa  776    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2727  catalase/peroxidase HPI  60.25 
 
 		 749 aa  876    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2142  catalase/peroxidase HPI  54.86 
 
 		 724 aa  788    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.501664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2984  catalase/peroxidase HPI  54.98 
 
 		 737 aa  780    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156049  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3208  catalase/peroxidase HPI  60.45 
 
 		 747 aa  875    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1056  catalase/peroxidase HPI  54.15 
 
 		 723 aa  760    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3132  catalase/peroxidase HPI  59.67 
 
 		 743 aa  863    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0936782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0308  catalase/peroxidase HPI  62.38 
 
 		 728 aa  927    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0547  catalase/peroxidase HPI  54.37 
 
 		 724 aa  765    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.474968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3740  catalase  61.04 
 
 		 715 aa  857    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1169  catalase/peroxidase HPI  62.38 
 
 		 728 aa  927    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  64.83 
 
 		 726 aa  910    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0415  catalase/peroxidase HPI  57.4 
 
 		 728 aa  826    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0875  catalase/peroxidase HPI  63.24 
 
 		 721 aa  921    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3322  catalase/peroxidase HPI  62.38 
 
 		 728 aa  927    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3356  catalase/peroxidase HPI  62.38 
 
 		 728 aa  927    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0335715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2713  catalase/peroxidase HPI  60.25 
 
 		 749 aa  876    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2578  catalase/peroxidase HPI  62.38 
 
 		 728 aa  927    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0709  catalase/peroxidase HPI  66.43 
 
 		 756 aa  955    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3451  catalase/peroxidase HPI  60.81 
 
 		 748 aa  885    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4032  catalase/peroxidase HPI  55.12 
 
 		 726 aa  778    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  61.31 
 
 		 757 aa  910    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2044  catalase/peroxidase HPI  55.71 
 
 		 717 aa  778    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.73931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2054  catalase/peroxidase HPI  59.12 
 
 		 758 aa  842    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.886153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>