218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2100 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_07388  Catalase-peroxidase (CP)(EC 1.11.1.6)(EC 1.11.1.7)(Peroxidase/catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96VT4]  64.17 
 
 
739 aa  941    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  70.51 
 
 
729 aa  1021    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  67.75 
 
 
757 aa  1011    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03828  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  62.1 
 
 
726 aa  871    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4043  catalase/peroxidase HPI  61.96 
 
 
726 aa  869    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2100  catalase/peroxidase  100 
 
 
727 aa  1493    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3668  catalase/peroxidase HPI  67.9 
 
 
751 aa  1007    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0509082  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0775  peroxidase/catalase oxidoreductase protein  72.93 
 
 
455 aa  689    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.392915  decreased coverage  0.00378616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10808  catalase/peroxidase  63.73 
 
 
740 aa  949    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.661719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1344  catalase/peroxidase HPI  60.14 
 
 
740 aa  882    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0725  catalase/peroxidase HPI  62.45 
 
 
741 aa  880    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4405  catalase/peroxidase HPI  62.94 
 
 
728 aa  925    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4530  catalase/peroxidase HPI  70.78 
 
 
756 aa  1082    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2391  catalase/peroxidase HPI  75.48 
 
 
728 aa  1129    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.347658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  63.98 
 
 
749 aa  947    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2454  catalase-peroxidase KatB  63.53 
 
 
721 aa  919    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  63.98 
 
 
749 aa  946    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2313  catalase-peroxidase KatB  63.48 
 
 
721 aa  920    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  72.8 
 
 
728 aa  1030    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  70.68 
 
 
726 aa  1019    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4208  haem catalase/peroxidase  71.05 
 
 
756 aa  1083    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260904  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3836  heme catalase/peroxidase  73.96 
 
 
736 aa  1028    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141049  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1635  heme catalase/peroxidase  68.22 
 
 
751 aa  986    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1741  heme catalase/peroxidase  76.68 
 
 
728 aa  1112    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0030  haem catalase/peroxidase  70.59 
 
 
729 aa  1008    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.187858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3366  catalase/peroxidase HPI  75.62 
 
 
728 aa  1132    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2201  haem catalase/peroxidase  68.17 
 
 
755 aa  1049    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1175  catalase/peroxidase HPI  84.71 
 
 
739 aa  1257    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3814  haem catalase/peroxidase  73.66 
 
 
728 aa  1092    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915162  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0386  haem catalase/peroxidase  75.1 
 
 
733 aa  1123    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0181  catalase/peroxidase HPI  64.26 
 
 
729 aa  909    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.877422  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1656  catalase/peroxidase HPI  62.83 
 
 
720 aa  925    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1282  catalase/peroxidase HPI  74.93 
 
 
728 aa  1122    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1918  catalase/peroxidase HPI  70.32 
 
 
744 aa  1056    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108605  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0610  catalase/peroxidase HPI  69.14 
 
 
732 aa  977    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2909  catalase/peroxidase HPI  65.63 
 
 
747 aa  894    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2433  catalase/peroxidase HPI  74.54 
 
 
718 aa  1088    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1586  catalase/peroxidase HPI  61.17 
 
 
735 aa  893    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.711142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3888  catalase  59.36 
 
 
738 aa  881    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.691403  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0361  catalase/peroxidase HPI  69.63 
 
 
732 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0678  catalase/peroxidase HPI  75.87 
 
 
731 aa  1120    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627364  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0772  haem catalase/peroxidase  70.6 
 
 
753 aa  1057    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468633  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1384  catalase/peroxidase HPI  60.92 
 
 
720 aa  898    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0223  catalase/peroxidase HPI  69.38 
 
 
732 aa  968    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0159  catalase/peroxidase HPI  61.45 
 
 
717 aa  891    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0037  catalase/peroxidase HPI  70.21 
 
 
729 aa  1027    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5371  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  72.65 
 
 
726 aa  1050    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1356  catalase/peroxidase HPI  70.52 
 
 
752 aa  1043    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2791  catalase/peroxidase HPI  69.99 
 
 
738 aa  1049    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2146  catalase/peroxidase HPI  60.33 
 
 
731 aa  826    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423847  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0242  catalase/peroxidase HPI  72.98 
 
 
728 aa  1088    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3169  catalase/peroxidase HPI  71.69 
 
 
728 aa  1026    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2682  catalase/peroxidase HPI  61.57 
 
 
749 aa  895    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1975  catalase/peroxidase HPI  60.2 
 
 
753 aa  869    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0626  catalase/peroxidase HPI  72.77 
 
 
726 aa  1026    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11937  catalase-peroxidase katG  65.36 
 
 
740 aa  915    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3306  hypothetical protein  64.66 
 
 
724 aa  921    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.706262  normal  0.467266 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1166  catalase/peroxidase  64.85 
 
 
724 aa  932    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.801479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0311  catalase/peroxidase HPI  63.22 
 
 
728 aa  942    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3379  catalase/peroxidase HPI  62.25 
 
 
739 aa  908    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0574  catalase/peroxidase HPI  62.68 
 
 
739 aa  910    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3713  catalase/peroxidase HPI  63.22 
 
 
728 aa  924    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1522  catalase/peroxidase HPI  64.3 
 
 
723 aa  925    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329951  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1917  catalase/peroxidase HPI  62.66 
 
 
738 aa  909    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.151995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3122  catalase/peroxidase HPI  56.62 
 
 
757 aa  808    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2686  catalase/peroxidase HPI  61.25 
 
 
724 aa  882    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0616  catalase/peroxidase HPI  75.1 
 
 
728 aa  1093    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.246482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5842  catalase/peroxidase HPI  62.17 
 
 
741 aa  863    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0726  catalase/peroxidase HPI  72.98 
 
 
728 aa  1088    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5199  catalase/peroxidase HPI  71.69 
 
 
728 aa  1026    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0306  catalase/peroxidase HPI  63.78 
 
 
728 aa  915    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.20325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3549  catalase/peroxidase HPI  62.39 
 
 
739 aa  910    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1387  catalase/peroxidase HPI  84.28 
 
 
736 aa  1223    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0755  catalase/peroxidase HPI  74.97 
 
 
732 aa  1087    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0577026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2497  catalase/peroxidase HPI  62.48 
 
 
725 aa  900    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0875  catalase/peroxidase HPI  66.62 
 
 
760 aa  937    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0745  catalase  60.72 
 
 
738 aa  908    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3270  catalase  62.64 
 
 
718 aa  895    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2727  catalase/peroxidase HPI  61.57 
 
 
749 aa  895    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2142  catalase/peroxidase HPI  61.01 
 
 
724 aa  919    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.501664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2984  catalase/peroxidase HPI  57.48 
 
 
737 aa  811    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156049  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3208  catalase/peroxidase HPI  62.32 
 
 
747 aa  910    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996485  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1056  catalase/peroxidase HPI  62.12 
 
 
723 aa  890    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3132  catalase/peroxidase HPI  69.75 
 
 
743 aa  1027    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0936782  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0308  catalase/peroxidase HPI  75.48 
 
 
728 aa  1129    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0547  catalase/peroxidase HPI  62.76 
 
 
724 aa  902    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.474968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3740  catalase  65.83 
 
 
715 aa  947    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1169  catalase/peroxidase HPI  75.48 
 
 
728 aa  1129    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  68.3 
 
 
751 aa  1010    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0415  catalase/peroxidase HPI  63.36 
 
 
728 aa  937    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0875  catalase/peroxidase HPI  71.19 
 
 
721 aa  1067    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3322  catalase/peroxidase HPI  75.48 
 
 
728 aa  1129    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3356  catalase/peroxidase HPI  75.48 
 
 
728 aa  1129    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0335715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2713  catalase/peroxidase HPI  61.57 
 
 
749 aa  895    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2578  catalase/peroxidase HPI  75.48 
 
 
728 aa  1129    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0709  catalase/peroxidase HPI  58.98 
 
 
756 aa  816    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3451  catalase/peroxidase HPI  61.29 
 
 
748 aa  884    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4032  catalase/peroxidase HPI  61.47 
 
 
726 aa  868    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3881  catalase/peroxidase HPI  63.37 
 
 
716 aa  901    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2044  catalase/peroxidase HPI  62.01 
 
 
717 aa  899    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.73931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>