208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0775 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  70.46 
 
 		 751 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  72.81 
 
 		 728 aa  662    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2625  catalase/peroxidase HPI  83.19 
 
 		 712 aa  771    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.030507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3414  catalase/peroxidase HPI  73.09 
 
 		 721 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2100  catalase/peroxidase  72.93 
 
 		 727 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3668  catalase/peroxidase HPI  70.46 
 
 		 751 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0509082  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0775  peroxidase/catalase oxidoreductase protein  100 
 
 		 455 aa  930    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.392915  decreased coverage  0.00378616 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1363  catalase/peroxidase HPI  74.51 
 
 		 757 aa  695    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0311  catalase/peroxidase HPI  72.71 
 
 		 733 aa  686    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0694  catalase/peroxidase HPI  82.24 
 
 		 728 aa  775    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.48718  normal  0.187409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4530  catalase/peroxidase HPI  76.86 
 
 		 756 aa  734    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2391  catalase/peroxidase HPI  85.31 
 
 		 728 aa  791    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.347658  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05880  heme catalase/peroxidase HPI  80.48 
 
 		 732 aa  753    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1362  catalase/peroxidase HPI  79.48 
 
 		 728 aa  740    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1936  catalase/peroxidase HPI  73.14 
 
 		 747 aa  673    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0354828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0134  catalase/peroxidase HPI  71.46 
 
 		 732 aa  653    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000854212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4208  haem catalase/peroxidase  77.73 
 
 		 756 aa  742    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3836  heme catalase/peroxidase  73.3 
 
 		 736 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1741  heme catalase/peroxidase  79.91 
 
 		 728 aa  757    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0030  haem catalase/peroxidase  73.52 
 
 		 729 aa  676    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.187858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3366  catalase/peroxidase HPI  85.09 
 
 		 728 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2201  haem catalase/peroxidase  73.9 
 
 		 755 aa  688    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1175  catalase/peroxidase HPI  75.11 
 
 		 739 aa  698    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3814  haem catalase/peroxidase  81.58 
 
 		 728 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0386  haem catalase/peroxidase  73.8 
 
 		 733 aa  705    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1533  catalase/peroxidase HPI  70.74 
 
 		 743 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4726  catalase/peroxidase HPI  73.8 
 
 		 729 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1282  catalase/peroxidase HPI  85.75 
 
 		 728 aa  800    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1918  catalase/peroxidase HPI  71.99 
 
 		 744 aa  656    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108605  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0610  catalase/peroxidase HPI  72.43 
 
 		 732 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2235  catalase/peroxidase HPI  71.33 
 
 		 752 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2433  catalase/peroxidase HPI  73.9 
 
 		 718 aa  709    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2660  catalase/peroxidase HPI  82.64 
 
 		 736 aa  771    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0755536 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0152  catalase/peroxidase HPI  71.68 
 
 		 732 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00125055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0361  catalase/peroxidase HPI  70.68 
 
 		 732 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0678  catalase/peroxidase HPI  77.07 
 
 		 731 aa  712    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627364  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0772  haem catalase/peroxidase  79.39 
 
 		 753 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3489  catalase/peroxidase HPI  73.74 
 
 		 723 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000850294  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0223  catalase/peroxidase HPI  73.8 
 
 		 732 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2231  catalase/peroxidase HPI  70.68 
 
 		 751 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0037  catalase/peroxidase HPI  73.96 
 
 		 729 aa  686    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5371  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  76.59 
 
 		 726 aa  720    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1356  catalase/peroxidase HPI  67.83 
 
 		 752 aa  653    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5085  catalase/peroxidase HPI  75.33 
 
 		 749 aa  705    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.060305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0148  catalase/peroxidase HPI  71.24 
 
 		 732 aa  664    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0029119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0242  catalase/peroxidase HPI  82.68 
 
 		 728 aa  777    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3169  catalase/peroxidase HPI  73.52 
 
 		 728 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1069  catalase/peroxidase HPI  69.65 
 
 		 735 aa  666    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2096  catalase/peroxidase HPI  72.49 
 
 		 730 aa  682    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00122798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0626  catalase/peroxidase HPI  74.12 
 
 		 726 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  73.58 
 
 		 729 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1585  catalase/peroxidase HPI  70.31 
 
 		 737 aa  662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1795  catalase/peroxidase HPI  71.77 
 
 		 735 aa  685    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2763  catalase/peroxidase HPI  80.53 
 
 		 732 aa  755    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5190  catalase  72.97 
 
 		 727 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.473568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0973  catalase/peroxidase HPI  70.83 
 
 		 738 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.281287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0642  catalase/peroxidase HPI  81.36 
 
 		 728 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3192  catalase/peroxidase HPI  79.34 
 
 		 732 aa  726    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3612  catalase/peroxidase HPI  73.09 
 
 		 721 aa  700    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0699012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0616  catalase/peroxidase HPI  81.36 
 
 		 728 aa  758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.246482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0619  catalase/peroxidase HPI  74.95 
 
 		 756 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0726  catalase/peroxidase HPI  82.68 
 
 		 728 aa  777    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5199  catalase/peroxidase HPI  73.52 
 
 		 728 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1517  catalase/peroxidase HPI  73.9 
 
 		 757 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1387  catalase/peroxidase HPI  75.11 
 
 		 736 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0755  catalase/peroxidase HPI  70.37 
 
 		 732 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0577026  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2078  catalase/peroxidase HPI  78.95 
 
 		 753 aa  741    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.582232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0871  catalase/peroxidase HPI  72.93 
 
 		 731 aa  702    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0581387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4680  catalase/peroxidase HPI  75.05 
 
 		 727 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.56744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1646  catalase/peroxidase HPI  72.27 
 
 		 732 aa  675    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0959  catalase/peroxidase HPI  75.76 
 
 		 733 aa  700    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.209132  normal  0.954436 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2177  catalase/peroxidase HPI  70.09 
 
 		 730 aa  645    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3132  catalase/peroxidase HPI  76.21 
 
 		 743 aa  709    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0936782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0308  catalase/peroxidase HPI  85.31 
 
 		 728 aa  791    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1432  catalase  74.51 
 
 		 757 aa  696    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3740  catalase  70.93 
 
 		 715 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1169  catalase/peroxidase HPI  85.31 
 
 		 728 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  74.62 
 
 		 726 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0875  catalase/peroxidase HPI  73.09 
 
 		 721 aa  700    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3322  catalase/peroxidase HPI  85.31 
 
 		 728 aa  791    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3356  catalase/peroxidase HPI  85.31 
 
 		 728 aa  791    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0335715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2578  catalase/peroxidase HPI  85.31 
 
 		 728 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0433  catalase/peroxidase HPI  74.45 
 
 		 736 aa  696    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1880  catalase/peroxidase HPI  70.59 
 
 		 741 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500233  normal  0.0120465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5078  catalase/peroxidase HPI  73.52 
 
 		 728 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8179  catalase/peroxidase HPI  75.49 
 
 		 745 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  72.41 
 
 		 757 aa  687    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1076  catalase/peroxidase HPI  71.62 
 
 		 737 aa  634  1e-180  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5378  catalase/peroxidase HPI  72.81 
 
 		 756 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07388  Catalase-peroxidase (CP)(EC 1.11.1.6)(EC 1.11.1.7)(Peroxidase/catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96VT4]  67.25 
 
 		 739 aa  626  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1635  heme catalase/peroxidase  65.65 
 
 		 751 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1663  catalase/peroxidase HPI  66.96 
 
 		 793 aa  626  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0100  catalase/peroxidase HPI  69.8 
 
 		 732 aa  625  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568909  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  64.11 
 
 		 749 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  63.89 
 
 		 749 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3365  catalase/peroxidase HPI  68.2 
 
 		 768 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2160  catalase/peroxidase HPI  67.76 
 
 		 758 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00356234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2655  catalase/peroxidase HPI  68.85 
 
 		 733 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2510  catalase/peroxidase HPI  68.79 
 
 		 721 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3881  catalase/peroxidase HPI  70.11 
 
 		 716 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>