218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5331 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_07388  Catalase-peroxidase (CP)(EC 1.11.1.6)(EC 1.11.1.7)(Peroxidase/catalase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96VT4]  65.56 
 
 		 739 aa  948    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5331  catalase/peroxidase HPI  100 
 
 		 729 aa  1491    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.850303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1851  catalase/peroxidase HPI  71.59 
 
 		 728 aa  1039    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03828  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  61.79 
 
 		 726 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4043  catalase/peroxidase HPI  61.65 
 
 		 726 aa  864    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2100  catalase/peroxidase  70.51 
 
 		 727 aa  1002    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3668  catalase/peroxidase HPI  65.21 
 
 		 751 aa  969    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0509082  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0775  peroxidase/catalase oxidoreductase protein  73.58 
 
 		 455 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.392915  decreased coverage  0.00378616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10808  catalase/peroxidase  62.69 
 
 		 740 aa  910    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.661719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1344  catalase/peroxidase HPI  58.91 
 
 		 740 aa  868    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0725  catalase/peroxidase HPI  61.41 
 
 		 741 aa  872    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4405  catalase/peroxidase HPI  61.11 
 
 		 728 aa  889    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4530  catalase/peroxidase HPI  68.09 
 
 		 756 aa  1030    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2391  catalase/peroxidase HPI  75.27 
 
 		 728 aa  1124    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.347658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  64.75 
 
 		 749 aa  963    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2454  catalase-peroxidase KatB  60.33 
 
 		 721 aa  877    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  64.75 
 
 		 749 aa  961    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2313  catalase-peroxidase KatB  60.87 
 
 		 721 aa  886    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1166  catalase/peroxidase  62.14 
 
 		 724 aa  900    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.801479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3881  catalase/peroxidase HPI  66.39 
 
 		 716 aa  916    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.653665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4208  haem catalase/peroxidase  69.15 
 
 		 756 aa  1048    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3836  heme catalase/peroxidase  68.84 
 
 		 736 aa  944    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1635  heme catalase/peroxidase  68.35 
 
 		 751 aa  969    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1741  heme catalase/peroxidase  73.27 
 
 		 728 aa  1051    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0030  haem catalase/peroxidase  76.58 
 
 		 729 aa  1114    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.187858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3366  catalase/peroxidase HPI  75.14 
 
 		 728 aa  1121    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.336723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2201  haem catalase/peroxidase  67.77 
 
 		 755 aa  1037    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1175  catalase/peroxidase HPI  68.61 
 
 		 739 aa  1008    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3814  haem catalase/peroxidase  74.45 
 
 		 728 aa  1102    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0386  haem catalase/peroxidase  70.7 
 
 		 733 aa  1066    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0181  catalase/peroxidase HPI  61.95 
 
 		 729 aa  843    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.877422  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1656  catalase/peroxidase HPI  61.31 
 
 		 720 aa  894    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1282  catalase/peroxidase HPI  75.45 
 
 		 728 aa  1139    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1918  catalase/peroxidase HPI  67.93 
 
 		 744 aa  1019    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0108605  normal  0.336609 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0610  catalase/peroxidase HPI  79.21 
 
 		 732 aa  1165    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2909  catalase/peroxidase HPI  64.96 
 
 		 747 aa  891    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2433  catalase/peroxidase HPI  71.99 
 
 		 718 aa  1052    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1586  catalase/peroxidase HPI  60.08 
 
 		 735 aa  879    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.711142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3888  catalase  59.8 
 
 		 738 aa  885    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.691403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0361  catalase/peroxidase HPI  78.63 
 
 		 732 aa  1167    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0678  catalase/peroxidase HPI  71.63 
 
 		 731 aa  1070    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.627364  normal  0.640869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0772  haem catalase/peroxidase  70.8 
 
 		 753 aa  1046    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1384  catalase/peroxidase HPI  57.87 
 
 		 720 aa  845    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0223  catalase/peroxidase HPI  79.48 
 
 		 732 aa  1159    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0159  catalase/peroxidase HPI  57.73 
 
 		 717 aa  835    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0037  catalase/peroxidase HPI  77.26 
 
 		 729 aa  1121    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5371  catalase/hydroperoxidase HPI(I)  70.26 
 
 		 726 aa  1004    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1356  catalase/peroxidase HPI  70.1 
 
 		 752 aa  1025    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2791  catalase/peroxidase HPI  64.27 
 
 		 738 aa  956    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2146  catalase/peroxidase HPI  59.06 
 
 		 731 aa  814    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0242  catalase/peroxidase HPI  75.14 
 
 		 728 aa  1104    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.698456  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3169  catalase/peroxidase HPI  70.48 
 
 		 728 aa  1009    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2682  catalase/peroxidase HPI  65.37 
 
 		 749 aa  952    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1975  catalase/peroxidase HPI  59.13 
 
 		 753 aa  844    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0626  catalase/peroxidase HPI  82.58 
 
 		 726 aa  1186    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11937  catalase-peroxidase katG  63.12 
 
 		 740 aa  889    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4032  catalase/peroxidase HPI  62.52 
 
 		 726 aa  887    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6389  catalase  75.07 
 
 		 726 aa  1090    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0311  catalase/peroxidase HPI  61.11 
 
 		 728 aa  907    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3379  catalase/peroxidase HPI  62.2 
 
 		 739 aa  909    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0574  catalase/peroxidase HPI  62.34 
 
 		 739 aa  909    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3713  catalase/peroxidase HPI  61.11 
 
 		 728 aa  892    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1522  catalase/peroxidase HPI  61.39 
 
 		 723 aa  889    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329951  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1917  catalase/peroxidase HPI  59.54 
 
 		 738 aa  863    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.151995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3122  catalase/peroxidase HPI  56.9 
 
 		 757 aa  809    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2686  catalase/peroxidase HPI  59.03 
 
 		 724 aa  835    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0616  catalase/peroxidase HPI  74.76 
 
 		 728 aa  1095    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.246482  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5842  catalase/peroxidase HPI  61.78 
 
 		 741 aa  860    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0726  catalase/peroxidase HPI  75.14 
 
 		 728 aa  1104    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5199  catalase/peroxidase HPI  70.48 
 
 		 728 aa  1009    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0332501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0306  catalase/peroxidase HPI  61.25 
 
 		 728 aa  877    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3549  catalase/peroxidase HPI  62.48 
 
 		 739 aa  915    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1387  catalase/peroxidase HPI  67.76 
 
 		 736 aa  983    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0755  catalase/peroxidase HPI  69.04 
 
 		 732 aa  970    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0577026  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2497  catalase/peroxidase HPI  60.93 
 
 		 725 aa  868    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0875  catalase/peroxidase HPI  67.78 
 
 		 760 aa  946    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0745  catalase  61.74 
 
 		 738 aa  923    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3270  catalase  58.96 
 
 		 718 aa  844    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2727  catalase/peroxidase HPI  65.37 
 
 		 749 aa  952    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2142  catalase/peroxidase HPI  59.73 
 
 		 724 aa  884    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.501664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2984  catalase/peroxidase HPI  57.63 
 
 		 737 aa  834    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156049  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3208  catalase/peroxidase HPI  64.66 
 
 		 747 aa  943    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1056  catalase/peroxidase HPI  58.29 
 
 		 723 aa  845    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3132  catalase/peroxidase HPI  70.55 
 
 		 743 aa  1032    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0936782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0308  catalase/peroxidase HPI  75.27 
 
 		 728 aa  1124    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0547  catalase/peroxidase HPI  61.66 
 
 		 724 aa  876    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.474968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3740  catalase  68.24 
 
 		 715 aa  954    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1169  catalase/peroxidase HPI  75.27 
 
 		 728 aa  1124    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2061  catalase/peroxidase HPI  64.81 
 
 		 751 aa  962    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0415  catalase/peroxidase HPI  61.38 
 
 		 728 aa  907    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0875  catalase/peroxidase HPI  72.06 
 
 		 721 aa  1053    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3322  catalase/peroxidase HPI  75.27 
 
 		 728 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3356  catalase/peroxidase HPI  75.27 
 
 		 728 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0335715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2713  catalase/peroxidase HPI  65.37 
 
 		 749 aa  952    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2578  catalase/peroxidase HPI  75.27 
 
 		 728 aa  1124    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0709  catalase/peroxidase HPI  57.91 
 
 		 756 aa  808    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3451  catalase/peroxidase HPI  63.76 
 
 		 748 aa  936    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3306  hypothetical protein  61.61 
 
 		 724 aa  870    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.706262  normal  0.467266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3897  catalase/peroxidase HPI  68.47 
 
 		 757 aa  1044    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2044  catalase/peroxidase HPI  58.02 
 
 		 717 aa  848    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.73931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>