80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5173 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  303  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  73.43 
 
 		 157 aa  219  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  66.9 
 
 		 153 aa  196  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  65.52 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  62.76 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  57.24 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  60.14 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  50.67 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  51.72 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  54.67 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  54.67 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  50.34 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  48.98 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  48.97 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  48.59 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  51.9 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  55.48 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  44.83 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  44.14 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  45.33 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  46.85 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  53.95 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  35.37 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  34.69 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  41.03 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  87  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 		 193 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.03 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.03 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.89 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.17 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  55.88 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  52.24 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  35.2 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.98 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.98 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  59.09 
 
 		 78 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  35.9 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  34.96 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.6 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.61 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.6 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  37.93 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  29.82 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.67 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.15 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  30.11 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  30.11 
 
 		 200 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  36 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  36.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1516  TrpR binding protein WrbA  30.85 
 
 		 198 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.348571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  40 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  30.43 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1214  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.332262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1229  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.570385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1183  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1078  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1194  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1813  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000250234  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1242  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01014  hypothetical protein  27.66 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1122  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.98388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2120  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2591  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.172537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01007  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1117  TrpR binding protein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2638  flavoprotein WrbA  27.66 
 
 		 198 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.836437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  26.79 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  33.33 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 198 aa  40.8  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0566  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  37.5 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.33 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  32.14 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2363  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 		 199 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00380027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2043  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 		 199 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0806093  normal  0.0679166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2261  TrpR binding protein WrbA  30.53 
 
 		 199 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.999788  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  28.42 
 
 		 200 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>