45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2331 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  247  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  82.5 
 
 		 82 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  81.33 
 
 		 86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  72.5 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  70.89 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  82.61 
 
 		 71 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  58.75 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  60.81 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  53.95 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  57.75 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  47.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  47.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  47.5 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  44.3 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  45 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  44.3 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  49.33 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  46.25 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  44.3 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  45.57 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  41.25 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  37.97 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  39.74 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  48.53 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  40.26 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  41.56 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  39.76 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  33 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.98 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.98 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.43 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.43 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.68 
 
 		 194 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.33 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  38.6 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  38.81 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  37.5 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.67 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.67 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.67 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  35 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.93 
 
 		 163 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>