49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0567 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  317  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  94.16 
 
 		 154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  81.82 
 
 		 154 aa  256  7e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  62.5 
 
 		 153 aa  206  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  60.93 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  46.05 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  42.48 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  41.38 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  39.42 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  38.93 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  39.33 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  38.78 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  35.86 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  39.46 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  39.46 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  44.72 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  40.27 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  36.91 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  39.69 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.53 
 
 		 193 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.16 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.16 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.97 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.39 
 
 		 194 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.16 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  37.27 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.35 
 
 		 163 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.35 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.35 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  36.3 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  35.37 
 
 		 152 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  34.16 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.18 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  46.34 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.18 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.31 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  35.54 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  38.64 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  39.74 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  36.62 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  40.85 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.68 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  26.61 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  44.07 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0956237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>